Teruggekeerd naar Frankrijk, dat toen werd geregeerd door Napoleon Bonaparte, zette Jules zijn ijverige loyaliteit aan de verbannen koninklijke familie voort. In 1804, een jaar na de dood van zijn zus, werd Jules betrokken bij de samenzwering van Cadoudal en Pichegru om Bonaparte te vermoorden, en werd hij gevangengezet tot 1813. Na de restauratie van de Bourbons werd hij beloond met verschillende eerbewijzen en functies. Hij bekleedde verschillende ambten, kreeg in 1820 van de paus de titel van “Prins” en in 1823 werd hij door koning Lodewijk XVIII ambassadeur in Groot-Brittannië. Een jaar later besteeg de vroegere vriend van zijn moeder de troon als Koning Charles X. Polignac’s politieke sympathieën veranderden niet en hij was een van de meest opvallende ultra-royalisten tijdens de Restauratie.
In die tijd ging het gerucht dat Polignac ultra-royalistische politiek steunde omdat hij dacht inspiratie te krijgen van de Maagd Maria. Er is echter weinig historisch bewijs voor dit verhaal. Noch in Polignac’s persoonlijke memoires, noch in de memoires van het Restauratiehof is er sprake van een dergelijke motivatie.
Op 8 augustus 1829 benoemde Charles X hem tot minister van Buitenlandse Zaken en in november daaropvolgend werd Polignac voorzitter van de Raad, in feite de machtigste politicus van Frankrijk. Zijn benoeming werd beschouwd als een stap in de richting van het omverwerpen van de grondwet en Polignac werd, samen met andere ministers, verantwoordelijk gehouden voor het besluit de Vier Ordonnanties uit te vaardigen, die de directe aanleiding vormden voor de revolutie van juli 1830.
Bij het uitbreken van de opstand sloeg hij op de vlucht, zwierf enige tijd door de wildernis van Normandië voordat hij in Granville werd gearresteerd. Tijdens zijn proces voor de Kamer van Volk werd hij veroordeeld tot een “eeuwigdurende” gevangenisstraf op het kasteel in Ham. Maar hij profiteerde van de amnestie van 1836, toen zijn straf werd omgezet in ballingschap. Tijdens zijn gevangenschap schreef hij Considerations politiques (1832). Daarna verbleef hij enkele jaren in ballingschap in Engeland voordat hem werd toegestaan Frankrijk weer te betreden, op voorwaarde dat hij nooit meer in Parijs zou gaan wonen.
Volgens de Legacies of British Slave-Ownership aan het University College London kreeg de Polignac als slavenhandelaar in de nasleep van de Slavery Abolition Act 1833 met de Slave Compensation Act 1837 een uitkering. De Britse regering sloot een lening af van 15 miljoen pond (ter waarde van 1,43 miljard pond in 2021) met rente van Nathan Mayer Rothschild en Moses Montefiore, die vervolgens door de Britse belastingbetalers werd afbetaald (eindigend in 2015). de Polignac werd in verband gebracht met drie verschillende claims, hij bezat 628 slaven in Saint Vincent en de Grenadines en ontving destijds een betaling van 15.765 pond (ter waarde van 1,51 miljoen pond in 2021). Hoewel een “buitenlander”, had de Polignac connecties in het Britse Rijk door zijn Schotse vrouw, Barbara Campbell (1788-1819), dochter van Duncan Campbell van Ardnave.
Uit zijn tweede huwelijk met Maria-Charlotte had Jules de Polignac zeven kinderen, waaronder Prins Ludovic de Polignac (1827-1904), een luitenant-kolonel in het Franse leger die deelnam aan de kolonisatie van Algerije; Prins Camille Armand Jules Marie de Polignac (1832-1913), generaal-majoor in het leger van de Geconfedereerden tijdens de Amerikaanse Burgeroorlog; en Prins Edmond de Polignac (1834-1901), een componist, muziektheoreticus en voorstander van de octatonische toonladder.
Jules stierf te St. Germain in 1847 aan de gevolgen van zijn gevangenschap. Ongeveer een maand daarvoor had hij de titel van duc de Polignac aangenomen bij de dood van zijn oudere broer, Armand, die zonder kinderen was gestorven.
Comte Pierre de Polignac, later Prins Pierre, Hertog van Valentinois (vader van Rainier III van Monaco en dus een voorvader van de hele huidige prinselijke familie) stamt af van een andere en cadet tak van de familie Polignac, die alleen de comitale rang heeft. Pierre was de jongste zoon, afstammend van de jongste zoon van de eerste hertog van Polignac.