Het belangrijkste verschil tussen snRNA en snRNP is dat snRNA’s kleine nucleaire RNA-moleculen zijn, terwijl snRNP’s of small nuclear ribonucleoproteins kleine nucleaire RNA-moleculen zijn met eiwitten.
snRNA’s zijn niet-coderende, biologisch actieve kleine RNA-moleculen met een gemiddelde grootte van 150 nucleotiden. Zij zijn gewoonlijk aanwezig in associatie met eiwitten als snRNPs in de natuurlijke staat. SnRNP’s zijn dus kleine kern-RNA’s met verschillende snRNP-specifieke eiwitten. snRNP’s zijn betrokken bij het mediëren of reguleren van post-translationele RNA-verwerkingsgebeurtenissen zoals splitsing, enz. Zowel snRNA als snRNP worden aangetroffen in de kern van eukaryote cellen.
CONTENTEN
1. Overzicht en Belangrijkste Verschil
2. Wat is snRNA
3. Wat is snRNP
4. Overeenkomsten tussen snRNA en snRNP
5. Vergelijking naast elkaar – snRNA vs snRNP in tabelvorm
6. Samenvatting
Wat is snRNA?
snRNA staat voor klein kern-RNA. Het zijn kleine nucleaire RNA-moleculen die worden aangetroffen binnen de splicing-spikkels en Cajal-lichaampjes van de celkern in eukaryote cellen. Een snRNA-molecuul heeft een gemiddelde lengte van 150 nucleotiden. Deze snRNA’s worden getranscribeerd door pol II en pol III. De voornaamste functie van snRNA is de verwerking van pre-messenger RNA (hnRNA) in de celkern. Zij zijn voornamelijk betrokken bij het mediëren of reguleren van post-translationele RNA-verwerkingsprocessen zoals splitsing. Door de werking van snRNA’s vinden nauwkeurige uitlijning en correcte excisie van introns plaats. Bovendien nemen snRNA’s deel aan de regulering van transcriptiefactoren (7SK RNA) of RNA polymerase II (B2 RNA) en de instandhouding van telomeren.
Figuur 01: snRNA
snRNA’s zijn niet-coderende RNA’s. Zij behoren tot een klasse van zeer overvloedig biologisch actief RNA dat in de kern gelokaliseerd is. Zij zijn altijd geassocieerd met eiwitmoleculen en bestaan als kleine nucleaire ribonucleoproteïnen (snRNP). Er zijn twee hoofdtypen snRNA’s: Sm-klasse snRNA en Lsm-klasse snRNA. U1, U2, U4, U4atac, U5, U7, U11, en U12 zijn Sm-klasse snRNA, terwijl U6 en U6atac Lsm-klasse snRNA zijn.
Wat is snRNP?
snRNP is een klein kern-RNA-molecuul gecombineerd met eiwitten. In het algemeen bevat elke snRNP een enkel snRNA en vele eiwitmoleculen. Daarom zijn snRNP’s kleine kern-RNA-moleculen en eiwitten. snRNP’s vormen samen met vele andere extra eiwitten het complex dat spliceosoom wordt genoemd en waar het splitsen van RNA plaatsvindt. snRNP’s hebben zowel het RNA-deel als het eiwitdeel nodig om introns te splitsen. Het RNA-deel is verantwoordelijk voor de endonuclease-splitsingen, aangezien het enzymatische activiteit heeft. Er zijn verschillende soorten snRNPs, en zij knippen op verschillende plaatsen.
Figuur 02: snRNP in spliceosoom
Naast splicing nemen snRNP’s deel aan de nucleaire maturatie van primaire transcripten in mRNA’s, genexpressieregulering, splice-donor in niet-canonieke systemen en aan de 3′-eindverwerking van replicatie-afhankelijke histon-mRNA’s. Er zijn twee speciale groepen van snRNPs als kleine nucleolaire RNPs (snoRNPs) en kleine Cajal-body RNPs (scaRNPs).
Wat zijn de overeenkomsten tussen snRNA en snRNP?
- Zowel snRNA als snRNP hebben kleine nucleaire RNA moleculen.
- snRNA’s combineren met eiwitten om snRNP’s te maken.
- Elke snRNP bevat een enkele snRNA.
- Zowel snRNA als snRNP worden gevonden in de kern van eukaryote cellen.
Wat is het verschil tussen snRNA en snRNP?
snRNA is een klein niet-coderend RNA-molecuul dat in de eukaryotische celkern gelokaliseerd is, terwijl snRNP een complex is van een enkel snRNA en snRNP-specifieke eiwitten. snRNPS zijn kleine nucleaire ribonucleoproteïnedeeltjes. snRNA is slechts een kleine RNA-molecule, terwijl snRNP een complex is van snRNA-molecule en strak gebonden eiwitten. Dit is dus het belangrijkste verschil tussen snRNA en snRNP.
Onderstaande infographic toont de verschillen tussen snRNA en snRNP in tabelvorm.
Samenvatting – snRNA vs snRNP
snRNA is een klasse van niet-coderende kleine kern-RNA’s die gelokaliseerd zijn in de eukaryotische kern. Zij vervullen belangrijke functies in verband met intron splicing en andere RNA verwerking. In natuurlijke toestand is snRNA geassocieerd met eiwitten en bestaat het als kleine nucleaire ribonucleoproteïnedeeltjes (snRNPs). snRNPs zijn, samen met vele andere eiwitten, betrokken bij de vorming van het spliceosoomcomplex om de splitsing van RNA uit te voeren. Dit vat dus het verschil samen tussen snRNA en snRNP.
Reference:
1. Stone, Lauren B, en Kasandra J Riley. “Small Nuclear Ribonucleoproteins (SnRNPs).” Wiley Online Library, American Cancer Society, 15 aug. 2014, onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/9780470015902.a0005038.
2. “Small Nuclear RNA. “ScienceDirect Topics, hier beschikbaar.
Image Courtesy:
1. “RF00003” – uit de Rfam-database (Public Domain) via Commons Wikimedia
2. “Spliceosome ball cycle new2” Door JBrain – (CC BY-SA 2.0 de) via Commons Wikimedia