LIPID MAPS®-afkortingen voor glycerofosfolipiden (GP)
De LIPID MAPS®-afkortingen voor glycerofosfolipiden (PC, PE, etc.) worden hier gebruikt om te verwijzen naar soorten met één of twee radylzijketens waarbij de structuren van de zijketens tussen haakjes worden aangegeven in het formaat ‘Headgroup(sn1/sn2)’ (bv. PC(16:0/18:1(9Z)). Standaard wordt uitgegaan van R-stereochemie aan de C-2 koolstof van glycerol en aanhechting van de kopgroep op de sn3 positie. Ook wordt standaard uitgegaan van acyl-ketens. Het “O-” voorvoegsel wordt gebruikt om de aanwezigheid van een alkyl-ether substituent aan te geven, bv. PC(O-16:0/18:1(9Z)), terwijl het “P-” voorvoegsel wordt gebruikt voor de 1Z-alkenyl-ether (Plasmalogeen) substituent, bv. PC(P-16:0/18:1(9Z)).
Voor moleculen met tegengestelde (S) stereochemie op C2 van de glycerolgroep en aanhechting van de kopgroep op de sn1-positie, wordt de stereochemiespecificatie van aan de afkorting toegevoegd. De afkorting “Headgroup(sn3/sn2)” wordt gebruikt.
Voor moleculen met onbekende stereochemie op de C-2-koolstof van de glycerolgroep wordt de stereochemiespecificatie van toegevoegd aan de afkorting en wordt de structuur getekend met C-2-stereochemie niet gespecificeerd.

Articles

Geef een antwoord

Het e-mailadres wordt niet gepubliceerd.