Le transport cyclique des électrons autour du photosystème I génère de l’ATP sans accumulation de NADPH dans les chloroplastes. Chez les angiospermes, le transport des électrons consiste en une voie dépendante de la protéine PGR5-PGRL1 et une voie dépendante du complexe NADH déshydrogénase du chloroplaste. Très probablement, la voie PGR5-PGRL1 correspond à la phosphorylation cyclique découverte par Arnon et contribue principalement à la formation du ΔpH dans la photosynthèse. La synthèse d’ATP utilise ce ΔpH formé par le transport d’électrons linéaire et cyclique PSI. De plus, l’acidification de la lumière thylakoïde régule à la baisse l’utilisation de l’énergie lumineuse dans le photosystème II ainsi que le transport des électrons par le complexe cytochrome b6f. En l’absence de PGR5, la NDH du chloroplaste compense dans une certaine mesure la formation réduite de ΔpH. De plus, la conductivité protonique est régulée à la hausse, probablement par l’intermédiaire de l’ATPase, chez les mutants PGR5. La machinerie photosynthétique forme probablement un réseau complexe pour maintenir une activité photosynthétique élevée dans des conditions lumineuses fluctuantes.