Yhteydet Pakistaniin
Intia pyysi 28. marraskuuta 2008 Pakistanin tiedustelupalvelun pääjohtajan, kenraaliluutnantti Ahmed Shuja Pashan läsnäoloa tutkintaprosessin käynnistyessä. Pakistan suostui aluksi pyyntöön, mutta perääntyi myöhemmin ja tarjoutui lähettämään Intiaan pääjohtajan edustajan Pashan itsensä sijasta. Iskujen välitön vaikutus tuntui maiden välillä käynnissä olevassa rauhanprosessissa. Intian ulkoministeri Pranab Mukherjee väitti Pakistanin viranomaisten toimimattomuutta terroristielementtejä kohtaan ja totesi: ”Jos he eivät toimi, asiat eivät jatku entiseen tapaan.” Myöhemmin Intia perui krikettijoukkueensa Pakistanin-kiertueen, joka oli suunniteltu tammi-helmikuulle 2009.
Intian yritys painostaa Pakistania puuttumaan terroristien toimintaan rajojensa sisäpuolella sai vahvan tuen kansainväliseltä yhteisöltä. Yhdysvaltain ulkoministeri Condoleezza Rice ja Britannian pääministeri Gordon Brown kiersivät Mumbain iskujen jälkeen sekä Intiassa että Pakistanissa. Diplomaattisen toiminnan vilkkaudessa, jota pidettiin lähinnä ”konfliktinestoharjoituksena”, Yhdysvaltain virkamiehet ja muut tahot kehottivat Pakistanin siviilihallitusta ryhtymään toimiin niitä vastaan, joiden epäiltiin osallistuneen iskuihin. Pelättiin, että jännitteet saattaisivat kärjistyä näiden kahden ydinaseistetun naapurin välillä. Intia pidättäytyi kuitenkin kokoamasta joukkoja Pakistanin rajalle, kuten se oli tehnyt 13. joulukuuta 2001 Intian parlamenttiin tehdyn iskun jälkeen, jonka olivat tehneet myös pakistanilaiset militantit. Sen sijaan Intia keskittyi hankkimaan kansainvälistä julkista tukea eri diplomaattisten kanavien ja tiedotusvälineiden kautta. Intia vetosi YK:n turvallisuusneuvostoon Jamaat-ud-Dawan vastaisten pakotteiden puolesta väittäen, että ryhmä oli Pakistanin vuonna 2002 kieltämän Lashkar-e-Taiban peitejärjestö. Intian pyyntöön suostuen turvallisuusneuvosto määräsi pakotteita Jamaat-ud-Dawaa vastaan 11. joulukuuta 2008 ja julisti ryhmän virallisesti terroristijärjestöksi.
Pakistan väitti pidättäneensä 8. joulukuuta 2008 Zaki-ur-Rehman Lakhvin, Lashkar-e-Taiban korkean tason johtajan ja Mumbain iskujen epäillyn päämiehen. Pakistanin turvallisuusjoukot tekivät ratsioita Jamaat-ud-Dawan toimistoihin eri puolilla maata. Tämä isku kesti kuitenkin vain muutaman päivän, minkä jälkeen Jamaat-ud-Dawan toimistojen ympärille asetettuja turvaköysiä höllennettiin. Pakistanin pääministeri Yousaf Raza Gillani totesi, että Jamaat-ud-Dawan toimintaa ei pitäisi estää, koska ”tuhannet ihmiset hyötyvät” ryhmän ”hyvinvointitoiminnasta”. Pakistan väitti lisäksi, että Intia ei ollut toimittanut sille riittäviä todisteita useita epäiltyjä terroristeja vastaan ja että kaikki toimet näitä epäiltyjä vastaan olivat mahdollisia vasta sen jälkeen, kun todisteet oli toimitettu ”diplomaattisten kanavien kautta eikä tiedotusvälineiden kautta”. Pakistan kieltäytyi Intian vaatimuksesta luovuttaa 20 henkilöä, joiden väitettiin osallistuneen useisiin Intian alueella tehtyihin terrori-iskuihin. Vuoden 2011 oikeudenkäynnissään Headley antoi kuitenkin yksityiskohtaisen todistajanlausunnon sekä Lashkar-e-Taiban että Pakistanin tiedustelupalvelun osallisuudesta Mumbain iskuihin.