Margaret Chan, (s. 1947, Hongkong), Hongkongissa syntynyt kiinalainen virkamies, joka toimi Maailman terveysjärjestön WHO:n pääjohtajana (2007-17).
Chan kävi Northcote College of Education -korkeakoulun Hongkongissa ennen kuin hän muutti Kanadaan, jossa hän suoritti tutkinnot B.A.:n (1973) ja M.D.:n (1977) tutkinnot Länsi-Ontarion yliopistossa. Hän suoritti myös kansanterveystieteen maisterin tutkinnon (1985) Singaporen kansallisessa yliopistossa. Hän liittyi Hongkongin terveysministeriöön vuonna 1978 ja tuli sen johtajaksi vuonna 1994. Hän toimi johtajana yhdeksän vuotta, jona aikana hän keskittyi tartuntatautien valvontaan ja torjuntaan sekä kansanterveysalan ammattilaisten koulutuksen parantamiseen.
Chanin johtajuutta kriisiaikana kiiteltiin laajalti sen jälkeen, kun ensimmäiset tappavan H5N1-lintuinfluenssaviruksen tapaukset ilmaantuivat ihmisiin Hongkongissa vuonna 1997. Hän antoi määräyksen tuhota kaupungin koko siipikarjakanta – noin 1,5 miljoonaa lintua. Määräys pantiin täytäntöön kolmessa päivässä, ja sen ansiosta viranomaiset saivat taudinpurkauksen hallintaan ja mahdollisesti estivät pandemian puhkeamisen. Chan nosti myös kansainvälistä profiiliaan hoitamalla vuoden 2003 SARS-epidemian, joka vaati lähes 300 ihmisen hengen Hongkongissa, vaikka jotkut kriitikot moittivat häntä siitä, ettei hän toiminut aggressiivisemmin sen jälkeen, kun epidemia oli alun perin puhjennut Kiinan naapuriprovinssissa Guangdongissa.
Vuosina 2003-2005 Chan toimi WHO:n ihmisen elinympäristön suojelun osaston johtajana, ja vuodesta 2005 vuoteen 2007 hän oli WHO:n apulaisosastopäällikkönä tartuntatautien osalta. Chan seurasi eteläkorealaista Lee Jong Wookia WHO:n pääjohtajana muutama kuukausi tämän yllättävän kuoleman jälkeen. Hallitukset suosittelivat häntä ja kymmentä muuta ehdokasta virkaan, ja WHO:n johtokunnan neljän äänestyskierroksen jälkeen Chan nousi ehdokkaaksi. Hänen valintansa vahvistettiin Maailman terveyskokouksen erityisistunnossa 9. marraskuuta. Kannattajat ylistivät Chanin kykyä käsitellä kriisitilanteita ja viittasivat hänen kokemukseensa lintuinfluenssa- ja SARS-epidemioiden hallinnasta.
Chanista tuli virallisesti pääjohtaja tammikuun 2007 alussa. Ensimmäisessä puheessaan virkaan astuttuaan hän esitteli erityistavoitteensa, jotka koskevat Afrikan ihmisten ja naisten terveyden parantamista kaikkialla maailmassa. ”Kaikki alueet, kaikki maat ja kaikki ihmiset ovat yhtä tärkeitä”, hän totesi, ”mutta meidän on keskitettävä huomiomme eniten apua tarvitseviin ihmisiin”. Vuonna 2009 Meksikosta alkaneen ja sittemmin ympäri maailmaa levinneen sikainfluenssatapauksen aikana Chan joutui vaikean tehtävän eteen arvioidessaan taudin mahdollisia maailmanlaajuisia terveysvaikutuksia. Kesäkuun 11. päivänä 2009 Chan julisti sikainfluenssan virallisesti pandemiaksi sen jälkeen, kun hän oli järjestänyt useita kokouksia hätäkomitean kanssa, jolta hän oli pyytänyt tieteellistä näyttöä päätöksensä pohjaksi. Se oli ensimmäinen pandemiaksi julistettu epidemia sitten vuoden 1968. Kriitikot syyttivät myöhemmin Chania ylireagoinnista, vaikka joidenkin arvioiden mukaan kuolleiden määrä oli yli 550 000.
Chan, joka valittiin uudelleen pääjohtajaksi vuonna 2012, joutui kohtaamaan muitakin terveyskriisejä, erityisesti Ebola-epidemian puhkeamisen Afrikassa (2014-15) ja Zika-viruksen leviämisen Amerikassa (2015-16). Hänen toimintansa molemmissa tilanteissa herätti kritiikkiä, ja jotkut väittivät, että hän reagoi hitaasti, erityisesti Ebola-epidemian tapauksessa. Lisäksi yhä useammin vaadittiin WHO:n uudistamista, sillä WHO:n katsottiin olevan kömpelö, puutteellisesti koordinoitu ja kykenemätön valvomaan tehokkaasti aluetoimistojensa laajaa verkostoa. Näistä haasteista huolimatta Chan sai kiitosta pyrkimyksistään edistää yleistä terveydenhuoltoa ja asettaa naisten terveys etusijalle. Hän erosi pääjohtajan tehtävästä, kun hänen toinen toimikautensa päättyi vuonna 2017.