Suryavarman II:n seuraaja Yaśovarman II (hallitsi 1160-66) kurotti myös kuninkaallisen nimensä varhaisempaan historiaan ja jäljitti sukujuurensa 9. vuosisadan loppupuolella olleeseen Rôluŏsin kauteen. Hänen valtakaudellaan saatiin valmiiksi useita Suryavarmanin aikana aloitettuja temppeleitä. Yaśovarmanin syrjäytti eräs virkamiehistään palattuaan sotaretkeltä Thaimaasta. Vallankaappauksen jälkeen Kambodžan prinssi, joka myöhemmin hallitsi nimellä Jayavarman VII (1181-1220), kiirehti kotiinsa Champasta – merkintöjen perusteella on epävarmaa, miksi hän oli siellä – kilpailemaan Kambodžan valtaistuimesta. Hän saapui paikalle liian myöhään, ja seuraavien 10 vuoden ajan hän odotteli, kun anastajalta katosi valta, ja Chamit valtasivat ja miehittivät Angkorin. Vuonna 1177 prinssi hyökkäsi Angkoriin oman armeijansa johdolla ja kukisti cham-joukot. Taistelut on kuvattu elävästi hänen temppelivuorensa, Bayonin, kohokuvissa. Estääkseen uudet cham-hyökkäykset Jayavarman liitti cham-pääkaupungin, ja Angkor hallitsi Champaa Jayavarmanin kuolemaan asti.
Kun hänen kampanjansa chameja vastaan oli ohi, tuleva monarkki työskenteli saadakseen Kambodžan hallintaansa. Eräässä kirjoituksessa viitattiin hänen kohtaamaansa valtakuntaan ”monien aurinkovarjojen varjostamana”, mikä on vertauskuva hallitsijoiden moninaisuudesta. Vuonna 1191, oletettavasti prosessin päätyttyä, Jayavarman asettui lopulta Angkoriin. Hän aloitti pian rakennus- ja julkisten töiden ohjelman, joka oli laajempi ja mahtavampi kuin mikään muu Angkoren historiassa. Hänen kirjoitustensa mukaan näihin hankkeisiin osallistui satojatuhansia ihmisiä.
Lukuiset temppelit, patsaat, kivisillat ja kirjoitukset Angkorin alueella ja muualla Kambodžassa todistavat Jayavarman VII:n pitkän valtakauden tarmokkuudesta. Hän rakensi ja vahvisti kaupunkia uudelleen. Hän oli kiihkeä Mahayana-koulukunnan buddhalainen; useat elämää suuremmat hallitsijan patsaat esittävät häntä mietiskelemässä. Kuten useimmat muutkin Kambodžan kuninkaat, hän kuitenkin suvaitsi ja suojeli myös hindulaisuutta ja paikallisia esi-isäkultteja. Hänen poikkeuksellinen temppelinsä Bayon, jonka useissa torneissa kussakin on taivaankappaleiden kasvot, jotka on käännetty ilmansuuntiin, on ehkä Angkorin monumenteista kiehtovin. Yaśovarman I:n Bakhengin tavoin Bayon sijaitsi Yaśovarmanin ajoista lähtien muuttuneen kuninkaallisen kaupungin keskellä ja symboloi Meru-vuorta. Temppelin patsaissa on kuvattu monia hindujumalia ja Buddhaa, kun taas kohokuvissa on kohtauksia tavallisesta elämästä, ja ne antavat kuvan 1200-luvun kambodžalaisista työssä, lepäämässä ja leikkimässä, mikä ei käy ilmi uskonnollisesti suuntautuneista kirjoituksista tai muiden temppelien kaiverruksista. Pohjareliefien vaatteet, työkalut, talot ja häränkärryt muistuttavat läheisesti nykypäivän Kambodžan maaseudulta löytyviä vaatteita, työkaluja, taloja ja häränkärryjä.