Aikuispotilaiden, joilla on trakeo-esofageaalinen fisteli, hoito riippuu siitä, onko fisteli synnynnäinen vai hankittu. Useimmilla aikuisilla on hankittu trakeo-esofageaalinen fisteli, ja hoito riippuu siitä, onko fisteli seurausta hyvänlaatuisesta prosessista vai pahanlaatuisesta kasvaimesta, joista jälkimmäinen on yleensä primaarinen ruokatorven syöpä. Hyvänlaatuista henkitorvi-ruokatorvi-fisteliä sairastavien potilaiden hoito on lähes aina aluksi tukihoitoa, jota seuraa lopullinen kirurginen korjaus. Yleensä kirurgiseen hoitoon kuuluu fistelin koosta ja sijainnista riippuen fistelin ensisijainen korjaus ja tarvittaessa henkitorven resektio ja rekonstruktio. Potilaiden, joilla on pahanlaatuinen trakeo-esofageaalinen fisteli, hoito riippuu siitä, onko potilas leikattavissa ja/tai lääketieteellisesti sopiva kirurgiseen hoitoon. Useimmilla potilailla, joilla on pahanlaatuinen trakeo-esofageaalinen fisteli, tauti on kuitenkin pitkälle edennyt, ja niitä voidaan hoitaa vain palliatiivisin toimenpitein. Pahanlaatuista henkitorvi-ruokatorvi-fisteliä sairastavien potilaiden palliatiivisen hoidon nykystandardi on endoskooppinen tai radiologinen katettujen itsestään laajenevien metallisten stenttien (SEMS) asettaminen, jotka mahdollistavat fistelin sulkemisen. Kaikkia kolmea kaupallisesti saatavilla olevaa katettua SEMS-tyyppiä on käytetty tähän tarkoitukseen menestyksekkäästi. Muita, harvinaisempia hoitovaihtoehtoja valikoiduille potilaille, joilla on pahanlaatuinen henkitorvi-ruokatorvi-fisteli, ovat solunsalpaajahoito ja sädehoito, kirurginen ohitusleikkaus, ruokatorven poissulkeminen sekä fistelin resektio ja korjaus.