Pankin työntekijät uskoivat varkaan olevan poliisi ja hyväksyivät hänen tarinansa pommista, koska pankinjohtajalle oli lähetetty etukäteen uhkaavia kirjeitä. Savu ja liekit osoittautuivat johtuvan varoitusraketista, jonka hän oli sytyttänyt auton alla ollessaan. Jossain vaiheessa varas hylkäsi pankkiauton ja siirsi metallilaatikot toiseen, aiemmin varastettuun autoon. Tämäkin auto hylättiin, ja laatikot siirrettiin jälleen toiseen aiemmin varastettuun autoon.
Rikospaikalle jäi 120 todistusaineistoa, muun muassa valkoiseksi maalattu ”poliisin” moottoripyörä. Todisteet olivat kuitenkin pääasiassa tavallisia arkipäiväisiä esineitä, jotka oli ripoteltu tarkoituksella poliisitutkinnan sekoittamiseksi.
Heti ryöstön jälkeen epäiltiin 19-vuotiasta miestä, poliisin poikaa. Hän kuoli kaliumsyanidimyrkytykseen 15. joulukuuta 1968. Hänellä ei ollut alibia. Rahoja ei kuitenkaan löytynyt hänen kuolinhetkellään. Hänen kuolemaansa pidettiin virallisten tietojen mukaan itsemurhana ja häntä pidettiin syyttömänä.
Poliisi käynnisti massiivisen poliisitutkinnan, jonka yhteydessä lähetettiin 780 000 montaasikuvaa ympäri Japania. Epäiltyjen listalla oli 110 000 nimeä, ja 170 000 poliisia osallistui tutkintaan – Japanin historian suurin tutkinta.
Joulukuun 12. päivänä 1969 Mainichi Shimbun epäili 26-vuotiasta miestä. Hänet pidätettiin asiaan liittymättömästä syytteestä, mutta hänellä oli alibi; ryöstö tapahtui päivänä, jolloin hän oli suorittamassa proktoroitua koetta. Koska pidätys perustui vääriin tekosyihin, pidätyksen tehnyttä poliisia, Mitsuo Mutoa, syytettiin vallan väärinkäytöstä.
Epäillyn 19-vuotiaan ystävä pidätettiin asiaan liittymättömästä syytteestä 15. marraskuuta 1975, juuri ennen vanhentumisaikaa. Hänellä oli suuri määrä rahaa ja häntä epäiltiin ryöstöstä. Hän oli 18-vuotias, kun ryöstö tapahtui. Poliisi pyysi häneltä selitystä suurelle rahamäärälle, mutta hän ei sanonut mitään, eikä poliisi pystynyt todistamaan, että hänen rahansa olivat peräisin ryöstöstä.