Čočka je spolu s rohovkou zodpovědná za lom světla na sítnici. Zonální vlákna připojují čočku k řasnatému tělesu, které drží čočku v poloze a určuje stupeň její akomodace. Mezi patologické stavy čočky patří katarakta, posun čočky a afakie. Nejčastějším onemocněním čočky je katarakta, při níž degenerativní procesy související s věkem vedou k zakalení čočky. Ectopia lentis, posun čočky, může být způsoben očními chorobami, úrazem nebo systémovým onemocněním. Zatímco částečné posunutí čočky (subluxace) znamená malou nebo žádnou ztrátu zrakové ostrosti, úplné posunutí čočky (luxace) vede k závažnému zhoršení zraku. Subluxace je častá u jedinců s Marfanovým syndromem a homocystinurií. Léčba posunuté čočky zahrnuje refrakční korekci a/nebo chirurgické odstranění čočky. Afakie je absence čočky, která může být vrozená nebo sekundární v důsledku úrazu či operace (např. operace katarakty). Klinické příznaky zahrnují špatnou zrakovou ostrost a úplnou ztrátu zrakové akomodace. Léčba spočívá v refrakční korekci pomocí afakických brýlí, kontaktních čoček nebo chirurgického zákroku.