Nukleinsyras smältkurva som visar hyperkromitet som en funktion av temperaturen
Mätningen av ljusabsorption är viktig för att övervaka smältning och annealing av DNA. Vid smältningstemperaturen (Tm) är DNA halvt denaturerat och halvt dubbelsträngat. Genom att sänka temperaturen under Tm skulle de denaturerade DNA-strängarna annealera tillbaka till ett dubbelsträngat DNA. När temperaturen ligger över Tm är DNA denaturerat.
Eftersom smältning sker nästan omedelbart vid en viss temperatur, kan man genom att övervaka DNA:s absorbans vid olika temperaturer få en indikation på smältningstemperaturen. Genom att kunna hitta temperaturen vid vilken DNA smälte och glödde kan forskarna separera DNA-strängar och glödda dem med andra DNA-strängar. Detta är viktigt för att skapa hybrid-DNA, som består av två DNA-strängar från olika källor. Eftersom DNA-strängar endast kan glödgas om de är likartade kan skapandet av hybrid-DNA indikera likheter mellan genomer från olika organismer.