Den viktigaste skillnaden mellan snRNA och snRNP är att snRNA är små nukleära RNA-molekyler medan snRNP eller små nukleära ribonukleoproteiner är små nukleära RNA-molekyler med proteiner.
snRNA är icke-kodande, biologiskt aktiva små RNA-molekyler med en genomsnittlig storlek på 150 nukleotider. De förekommer vanligtvis i förening med proteiner som snRNPs i naturligt tillstånd. SnRNPs är således små nukleära RNA med flera snRNP-specifika proteiner. snRNPs är involverade i förmedling eller reglering av posttranslationella RNA-bearbetningshändelser, t.ex. splicing etc. Både snRNA och snRNP finns i kärnan i eukaryota celler.
CONTENTS
1. Översikt och viktiga skillnader
2. Vad är snRNA
3. Vad är snRNP
4. Likheter mellan snRNA och snRNP
5. Jämförelse sida vid sida – snRNA vs. snRNP i tabellform
6. Sammanfattning
Vad är snRNA?
snRNA står för små nukleära RNA. De är små nukleära RNA-molekyler som finns i splicing speckles och Cajalkropparna i cellkärnan i eukaryota celler. En snRNA-molekyl har en genomsnittlig längd på 150 nukleotider. Dessa snRNA:er transkriberas av pol II och pol III. SnRNA:s huvudsakliga funktion är bearbetningen av pre-messenger RNA (hnRNA) i kärnan. De är huvudsakligen involverade i förmedling eller reglering av posttranslationella RNA-bearbetningshändelser, t.ex. splicing. På grund av snRNA:s verkan sker en exakt anpassning och korrekt excision av introner. Dessutom deltar snRNA i regleringen av transkriptionsfaktorer (7SK RNA) eller RNA-polymeras II (B2 RNA) och upprätthåller telomerer.
Figur 01: snRNA
snRNA är icke-kodande RNA. De tillhör en klass av mycket rikligt förekommande biologiskt aktiva RNA som är lokaliserade i kärnan. De är alltid associerade med proteinmolekyler och existerar som små nukleära ribonukleoproteiner (snRNP). Det finns två huvudtyper av snRNA: Sm-klassens snRNA och Lsm-klassens snRNA. U1, U2, U4, U4atac, U5, U7, U11 och U12 är Sm-klass snRNA medan U6 och U6atac är Lsm-klass snRNA.
Vad är snRNP?
snRNP är en liten nukleär RNA-molekyl i kombination med proteiner. I allmänhet innehåller varje snRNP ett enda snRNA och många proteinmolekyler. Därför är snRNPs små nukleära RNA-molekyler och proteiner. snRNPs bildar tillsammans med många andra ytterligare proteiner det komplex som kallas spliceosom där RNA-splicing äger rum. snRNPs behöver både RNA-delen och proteindelen för att kunna splica ut introner. RNA-komponenten är ansvarig för endonukleaseklippningarna eftersom den har enzymatisk aktivitet. Det finns olika typer av snRNPs och de skär på olika ställen.
Figur 02: snRNP i spliceosomen
Förutom splicing deltar snRNP:erna i den nukleära mognaden av primära transkriptioner i mRNA:er, reglering av genuttrycket, splicedonator i icke-kanoniska system och i 3′-ändlig bearbetning av replikationsberoende histon-mRNA:er. Det finns två särskilda grupper av snRNPs som små nukleolära RNP:er (snoRNPs) och små Cajal-body RNP:er (scaRNPs).
Vad är likheterna mellan snRNA och snRNP?
- Både snRNA och snRNP har små nukleära RNA-molekyler.
- snRNAs kombineras med proteiner för att bilda snRNPs.
- Varje snRNP innehåller ett enda snRNA.
- Både snRNA och snRNP finns i kärnan i eukaryota celler.
Vad är skillnaden mellan snRNA och snRNP?
snRNA är en liten icke-kodande RNA-molekyl som är lokaliserad i den eukaryotiska cellens kärna medan snRNP är ett komplex bestående av ett enda snRNA och snRNP-specifika proteiner. snRNPS är små nukleära ribonukleoproteinpartiklar. snRNA är bara en liten RNA-molekyl medan snRNP är ett komplex av en snRNA-molekyl och tätt bundna proteiner. Detta är alltså den viktigaste skillnaden mellan snRNA och snRNP.
Understående infografik visar skillnaderna mellan snRNA och snRNP i tabellform.
Sammanfattning – snRNA vs snRNP
snRNA är en klass av icke-kodande små nukleära RNA som är lokaliserade i den eukaryota kärnan. De fyller viktiga funktioner i samband med intronsplicering och annan RNA-bearbetning. I naturligt tillstånd är snRNA associerat med proteiner och existerar som små nukleära ribonukleoproteinpartiklar (snRNPs). snRNPs är tillsammans med många andra proteiner involverade i bildandet av spliceosomkomplexet för att utföra RNA-splicing. Detta sammanfattar alltså skillnaden mellan snRNA och snRNP.
Referens:
1. Stone, Lauren B och Kasandra J Riley. ”Small Nuclear Ribonucleoproteins (SnRNPs)”. Wiley Online Library, American Cancer Society, 15 Aug. 2014, onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/9780470015902.a0005038.
2. ”Small Nuclear RNA.” ScienceDirect Topics, Available here.
Image Courtesy:
1. ”RF00003” – från Rfam-databasen (Public Domain) via Commons Wikimedia
2. ”Spliceosome ball cycle new2” By JBrain – (CC BY-SA 2.0 de) via Commons Wikimedia