LIPID MAPS® forkortelser for glycerophospholipider (GP)
LIPID MAPS® forkortelserne for glycerophospholipider (PC, PE, osv.) anvendes her til at henvise til arter med en eller to radylsidekæder, hvor sidekædernes strukturer er angivet i parentes i “Headgroup(sn1/sn2)”-formatet (f.eks. PC(16:0/18:1(9Z)). Som standard antages R-stereokemi ved glycerolens C-2-kulstof og tilknytning af hovedgruppen ved sn3-positionen. Acylkæder antages også som standard. Præfikset “O-” anvendes til at angive tilstedeværelsen af en alkylethersubstituent, f.eks. PC(O-16:0/18:1(9Z)), mens præfikset “P-” anvendes for 1Z-alkenylether-(Plasmalogen)-substituenten, f.eks. PC(P-16:0/18:1(9Z)).
For molekyler med modsat (S)-stereokemi ved C2 af glycerolgruppen og tilknytning af hovedgruppen ved sn1-positionen, tilføjes stereokemisk specifikation af til forkortelsen. Der anvendes forkortelsesformatet “Headgroup(sn3/sn2)”.
For molekyler med ukendt stereokemi ved glycerolgruppens C-2-kulstofstof er den stereokemiske specifikation af knyttet til forkortelsen, og strukturen er tegnet med C-2-stereokemi uspecificeret.

Articles

Skriv et svar

Din e-mailadresse vil ikke blive publiceret.