Succesorul lui Suryavarman al II-lea, Yaśovarman al II-lea (a domnit între 1160 și 1166), a ajuns, de asemenea, în istoria mai veche pentru numele său regal, urmărindu-și descendența până în perioada Rôluŏs de la sfârșitul secolului al IX-lea. În timpul domniei sale, mai multe temple începute sub Suryavarman au fost finalizate. Yaśovarman a fost răsturnat de unul dintre oficialii săi după ce s-a întors dintr-o campanie militară în Thailanda. În urma loviturii de stat, un prinț cambodgian, care a domnit mai târziu sub numele de Jayavarman al VII-lea (1181-c. 1220), s-a grăbit să se întoarcă acasă din Champa – nu se știe sigur din inscripțiile sale de ce se afla acolo – pentru a concura pentru tronul cambodgian. A ajuns prea târziu și, în următorii 10 ani, a așteptat ca uzurpatorul să piardă controlul, iar Angkor a fost invadat și ocupat de către Chams. În 1177, în fruntea unei armate proprii, prințul a atacat Angkor și a învins forțele Cham. Bătăliile sunt înfățișate în mod viu în basoreliefurile de pe muntele templului său, Bayon. Pentru a preveni alte atacuri Cham, Jayavarman a anexat capitala Cham, iar Angkor a controlat Champa până la moartea lui Jayavarman.
Când campania sa împotriva Chams s-a încheiat, viitorul monarh a lucrat pentru a aduce Cambodgia sub controlul său. O inscripție se referea la regatul pe care l-a întâlnit ca fiind „umbrit de multe umbrele”, o metaforă pentru o multiplicitate de conducători. În 1191, probabil când procesul a fost finalizat, Jayavarman s-a stabilit în sfârșit în Angkor. În scurt timp s-a angajat într-un program de construcții și lucrări publice care a fost mai amplu și mai grandios decât oricare altul din istoria Angkoreană. Conform inscripțiilor sale, sute de mii de oameni au fost implicați în aceste proiecte.
Numeroase temple, statui, poduri de piatră și inscripții din regiunea Angkor și din alte părți ale Cambodgiei atestă vigoarea îndelungatei domnii a lui Jayavarman al VII-lea. El a reconstruit și refortificat orașul. A fost un budist fervent al școlii Mahayana; mai multe statui ale monarhului, de dimensiuni mai mari decât cele reale, îl înfățișează în meditație. Cu toate acestea, la fel ca majoritatea celorlalți regi cambodgieni, a tolerat și patronat hinduismul și cultele locale ale strămoșilor. Templul său extraordinar, Bayon, cu multiplele sale turnuri, fiecare purtând chipuri de divinități întoarse în direcțiile cardinale, este poate cel mai intrigant dintre monumentele de la Angkor. Ca și Bakheng-ul lui Yaśovarman I, Bayon se afla în centrul orașului regal – care se schimbase de pe vremea lui Yaśovarman – și simboliza Muntele Meru. Mulți zei hinduși și Buddha sunt reprezentați în statuile templului, în timp ce basoreliefurile înfățișează scene din viața obișnuită, oferind o imagine a cambodgienilor din secolul al XII-lea la muncă, odihnă și joacă care nu reiese din inscripțiile cu orientare religioasă sau din sculpturile din alte temple. Îmbrăcămintea, uneltele, casele și căruțele cu boi din basoreliefuri se aseamănă foarte mult cu cele întâlnite astăzi în mediul rural cambodgian.
.