Tomás Luis de Victoria foi o sétimo filho de 11 anos nascido em Ávila de Francisco Luis de Victoria e Francisca Suárez de la Concha. A morte de seu pai em 1557 deixou a família aos cuidados de um tio que era sacerdote. Victoria passou vários anos como menino de coro na Catedral de Ávila.
Em 1565 (ou 1563) Victoria entrou no Colégio Alemão em Roma. Esta era uma escola jesuíta generosamente apoiada por Filipe II e Otto von Truchsess von Waldburg, o cardeal arcebispo de Augsburg. A Irmã Victoria serviu como organista na igreja aragonesa de S. Maria di Monserrato, em Roma, de 1569 a 1574. Em 1571 o Colégio Alemão contratou-o para ensinar música aos jovens rapazes. Ele foi ordenado em 28 de agosto de 1575. Desde esse ano até 1577 dirige o coro do Colégio Alemão, cantando na igreja de S. Apollinare, em Roma; de 1578 a 1585, é capelão de S. Girolamo della Carità, a igreja dos oratorianos recém-fundados em Roma.
Victoria regressou a Espanha em 1587 e até 1603 foi capelão do convento de Descalzas Reales, em Madrid, onde residiam a irmã de Filipe II, a Imperatriz-Maria Viúva, e sua filha, a Princesa Margarida. De 1604 até a sua morte em 27 de agosto de 1611, foi também o organista do convento.
Em 1572 Victoria dedicou a sua primeira, e ainda mais famosa, publicação ao Cardeal Truchsess, um grande conhecedor da música da igreja. Os 33 motectas que variam de quatro a oito vozes nesta coleção incluem os sensuosos Vere languores e O vos omnes, que até hoje formam o alicerce da reputação de Victoria junto ao grande público que nada sabe de seus Magnificats, hinos, seqüências, salmos, antífonas e 20 Missas – cinco das quais apareceram em 1576, outras quatro em 1583, sete em 1592 e o resto em 1600 e 1605.
Nos seus 1572 motets Victoria seguiu de perto a técnica de detalhe de Giovanni Pierluigi da Palestrina, evocando um domínio comandante do tratamento da dissonância de Palestrina. O contacto pessoal com Palestrina e talvez até mesmo as lições explicam provavelmente a absorção da técnica por Victoria. De 1566 a 1571 Palestrina serviu como capela-mestre no Colégio Romano, perto do Colégio Alemão. O que distingue a maneira pessoal de Victoria em 1572 da de Palestrina é o frequente recurso do compositor mais jovem a acasos impressos, o seu gosto pelo que agora seria chamado de movimento melódico menor (agudos ascendentes, naturais descendentes), e a antecipação da harmonia funcional do século XIX.
Ao longo da sua carreira, mesmo quando escrevia Missa Quarti toni (1592), Victoria sempre conseguiu soar como uma compositora “major-minor” em vez de uma compositora verdadeiramente “modal”. Para ele Quarti toni significava Um pequeno cadenciamento sobre o dominante. Em 1600 ele publicou Missae, Magnificat, motecta, psalmi, & entre outros, que consiste em grande parte de música F-major acompanhada de órgão. É verdade, ele reverteu para chaves menores desacompanhadas no Officium defunctorum, publicado em 1605 em homenagem à sua padroeira, a Imperatriz Maria Viúva, mas esta era música funerária. Em nenhuma das publicações de Palestrina ele especificou acompanhamentos de órgão. Victoria fez – mesmo publicando peças de órgão em 1592 e 1600.
A miscelânea de Victoria de 1600 inclui uma Missa pro Victoria modelada no famoso chanson de batalha de Clément Janequin. Philip III gostou desta ebuliente missa de nove vozes fundada sobre um modelo secular mais do que qualquer outra obra de Victoria, mas contraria toda a qualidade que Victoria tem para o seu público moderno. No entanto, pelo menos prova que ele tem sido mais versátil emocional e tecnicamente do que os seus admiradores admitirão. A parcialidade de Filipe III por ela serviu como um gambit de vendas quando Victoria procurou fundos de sua publicação para tirar seu irmão mais novo da prisão.