O plasmídeo de 2 microns de Saccharomyces cerevisiae é um elemento de ADN multi-cópia egoísta relativamente pequeno que reside no núcleo da levedura com um número de cópia de 40-60 por célula haplóide. O plasmídeo é capaz de persistir em populações hospedeiras com estabilidade quase cromossômica com a ajuda de um sistema de partição e um sistema de controle de número de cópias. A primeira parte deste artigo descreve as propriedades do sistema de particionamento compreendendo duas proteínas codificadas com plasmídeos, Rep1 e Rep2, e um locus STB de particionamento. A evidência atual suporta um modelo no qual o sistema Rep-STB associa a segregação plasmídea à segregação cromossômica, promovendo a associação física de moléculas plasmídicas com cromossomos. Na segunda parte, o foco é o sistema de recombinação específico do local Flp alojado pelo plasmídeo, que desempenha um papel crítico na manutenção do número de cópias plasmídicas em estado estável. O sistema Flp corrige qualquer diminuição na população de plasmídeos, promovendo a amplificação do plasmídeo através de um mecanismo de replicação do círculo rolante induzido pela recombinação. A amplificação plasmídea adequada, sem aumento do número de cópias, é assegurada pela regulação positiva e negativa da expressão do gene FLP pelas proteínas codificadas com plasmídeos e pelo controle do nível/actividade Flp através da modificação pós-tradução do Flp pelo sistema de sumoilação celular. O sistema Flp tem sido utilizado com sucesso para compreender mecanismos de recombinação específicos do local e para trazer alterações genéticas direcionadas para tratar de problemas fundamentais em biologia e para atingir os objetivos da bioengenharia. Uma aplicação particularmente interessante, e talvez menos conhecida e subvalorizada, do Flp na revelação de topologias únicas de DNA necessárias para conferir competência funcional às máquinas de DNA-proteína é discutida.