Os funcionários do banco acreditavam que o ladrão era um agente da polícia, e aceitaram a sua história sobre a bomba porque cartas ameaçadoras tinham sido enviadas ao gerente do banco antes. A fumaça e as chamas acabaram sendo o resultado de uma chama de advertência que ele tinha acendido enquanto estava debaixo do carro. Em algum momento, o ladrão abandonou o carro do banco e transferiu as caixas metálicas para outro carro, roubado de antemão. Esse carro também foi abandonado, e as caixas foram novamente transferidas para outro veículo previamente roubado.
Foram deixadas 120 provas no local do crime, incluindo a motocicleta “policial”, que tinha sido pintada de branco. No entanto, as provas eram principalmente itens comuns no dia-a-dia, dispersos de propósito para confundir a investigação policial.
Um homem de 19 anos, filho de um policial, foi suspeito logo após o roubo. Ele morreu de envenenamento por cianeto de potássio em 15 de dezembro de 1968. Ele não tinha álibi. No entanto, o dinheiro não foi encontrado na altura da sua morte. Sua morte foi considerada suicídio e ele foi considerado inocente, de acordo com os registros oficiais.
Uma investigação policial maciça foi lançada, colocando 780.000 fotos de montagem em todo o Japão. A lista de suspeitos incluía 110.000 nomes, e 170.000 policiais participaram da investigação – a maior investigação da história japonesa.
Em 12 de dezembro de 1969, um homem de 26 anos foi suspeito pelo Mainichi Shimbun. Ele foi preso sob uma acusação não relacionada, mas tinha um álibi; o roubo ocorreu no dia em que ele estava fazendo um exame proctorial. Como a prisão foi feita com base em falsas acusações, o policial que o prendeu, Mitsuo Muto, foi acusado de abuso de poder.
Um amigo do suspeito de 19 anos de idade foi preso sob uma acusação não relacionada, em 15 de novembro de 1975, pouco antes da prescrição. Ele tinha uma grande quantia de dinheiro e era suspeito do roubo. Ele tinha 18 anos quando o roubo ocorreu. A polícia pediu-lhe uma explicação para a grande quantia de dinheiro, mas ele não disse nada e eles não conseguiram provar que o seu dinheiro tinha vindo do assalto.