Restoration
Cele Planu Ochrony Ryb Rodzimych w Yellowstone (2010) obejmują przywrócenie liczebności YCT w jeziorze do poziomu udokumentowanego w późnych latach 90-tych, utrzymanie dostępu do tarła YCT w co najmniej 45 z 59 historycznych dopływów tarłowych jeziora Yellowstone oraz utrzymanie lub odtworzenie genetycznie czystego YCT w obecnym zakresie strumieni zajętych przez czystego lub hybrydowego YCT.
Rzeka Lamar
Ponieważ w głównym nurcie rzeki Lamar nie istnieją żadne bariery dla migracji ryb w górę rzeki, potomkowie pstrąga tęczowego zarybionego w latach 30-tych rozprzestrzenili się do wielu miejsc w całym dziale wodnym i zhybrydyzowali się z pstrągiem gardłowym. Analiza genetyczna wskazuje, że pstrągi gardłowe w górnym biegu rzeki Lamar pozostają genetycznie niezmienione.
Aby chronić pozostałe pstrągi gardłowe w Yellowstone, NPS wprowadził metodę selektywnego usuwania. W 2014 r. wprowadzono obowiązkowe przepisy dotyczące połowu z zabiciem wszystkich pstrągów tęczowych złowionych w górę rzeki Lamar River Bridge. Obecnie przepisy stanowią, że wszystkie nierodzime ryby i możliwe do zidentyfikowania hybrydy pstrąga gardłowego x tęczowego powyżej Knowles Falls muszą zostać zabite. Selektywne usuwanie za pomocą elektropołowów jest prowadzone corocznie przez dolinę Lamar od 2013 roku. W 2019 r. 7% ryb pobranych podczas badań elektropołowowych w górę kanionu rzeki Lamar zostało sklasyfikowanych jako pstrąg tęczowy lub hybrydowy. Ten niski odsetek stanowi wyraźny kontrast z pracami prowadzonymi poniżej Kanionu.
W 2015 roku pobrano próbki 136 ryb poniżej mostu na rzece Lamar. Na podstawie identyfikacji w terenie, 48% stanowiły pstrągi gardłowe Yellowstone, 19% pstrągi tęczowe, a 31% hybrydy. Większość z tych ryb została oznakowana za pomocą nadajników radiowych lub pasywnych zintegrowanych transponderów (PIT) jako część trwającego projektu badawczego mającego na celu określenie czy pstrąg potokowy, tęczowy i hybrydy pstrąga potokowego wykorzystują te same obszary do odbycia tarła i czasu tarła oraz w celu poinformowania o działaniach zarządczych.
Slough Creek
W Slough Creek, hybrydy pstrąga potokowego i tęczowego były znajdowane z rosnącą częstotliwością w ciągu ostatniej dekady. W przeciwieństwie do rzeki Lamar, Slough Creek jest mniejszy, a w górnym biegu rzeki została zbudowana bariera uniemożliwiająca przemieszczanie się ryb. Po wprowadzeniu bariery i uniemożliwieniu pstrągom tęczowym przedostawania się do systemu, istniejące pstrągi tęczowe i hybrydy mogą być skutecznie zarządzane poprzez wędkarstwo i odławianie prądem elektrycznym.
Soda Butte Creek
Pstrągi potokowe zadomowiły się w Soda Butte Creek poza granicami parku i rozprzestrzeniły się w dół rzeki do wód parku we wczesnych latach 2000. Początkowo, pstrągi potokowe były odizolowane w górnych odcinkach wód przez barierę chemiczną stworzoną przez zanieczyszczenie kopalni w górę rzeki Cooke City, Montana. Kiedy odpady kopalni zostały zasypane, a jakość wody poprawiła się, pstrąg potokowy przeszedł w dół rzeki i zaczął negatywnie wpływać na pstrąga potokowego.
Przez prawie dwie dekady, międzyagencyjne badania elektropołowowe wystarczyły do utrzymania populacji pstrąga potokowego na niskim poziomie, ale nie zapobiegły rozszerzeniu zasięgu. Z czasem, pstrąg potokowy rozprzestrzenił się w dół rzeki i stał się zagrożeniem dla rzeki Lamar. Ponadto, hybrydyzacja pstrąga tęczowego nadal była identyfikowana u pstrąga gardłowego w górę rzeki Ice Box Canyon.
W 2013 roku Ice Box Falls został zmodyfikowany tak, aby stanowił całkowitą barierę dla przemieszczania się ryb w górę rzeki, tym samym całkowicie eliminując zagrożenie ze strony nierodzimych ryb przemieszczających się w górę rzeki. Podczas zabiegu chemicznego w 2015 r. usunięto prawie 450 pstrągów potokowych. Tylko dwa pstrągi potokowe zostały zebrane z Soda Butte Creek podczas drugiego zabiegu w 2016 roku. Od 2017 roku, pobieranie próbek eDNA i elektropołowy, jak również badania elektropołowowe, nie znalazły żadnych dowodów na obecność pstrąga potokowego w systemie. Jest to dobry wskaźnik, że całkowite zabicie zostało osiągnięte w drenażu.
Elk Creek Complex
W Elk Creek istnieje naturalna bariera kaskadowa tuż przed jej ujściem do rzeki Yellowstone. Kaskada uniemożliwiała rybom naturalne zasiedlenie systemu, więc kompleks strumieni Elk, Lost i Yancey Creeks (Elk Creek Complex) był bezrybny podczas pierwszego zarybienia pstrągiem gardłowym we wczesnych latach 20-tych. W 1942 roku, strumienie zostały zarybione pstrągiem potokowym, co spowodowało całkowitą utratę pstrąga potokowego.
Kompleks Elk Creek był traktowany rotenonem corocznie od 2012 do 2014 roku w celu usunięcia pstrąga potokowego. Po oczyszczeniu z pstrąga potokowego rozpoczęto reintrodukcję rodzimego pstrąga gardłowego Yellowstone. Potoki Antelope i Pebble dostarczyły ryb do zarybienia kompleksu Elk Creek w październiku 2015 roku. Dodatkowe zarybienia miały miejsce w 2016 i 2017 roku. Naturalna reprodukcja została również udokumentowana w 2017 roku podczas badań elektropołowowych.