Skróty LIPID MAPS® dla glicerofosfolipidów (GP)
Skróty glicerofosfolipidów LIPID MAPS® (PC, PE, itd.) są tu stosowane w odniesieniu do gatunków z jednym lub dwoma bocznymi łańcuchami radylowymi, gdzie struktury łańcuchów bocznych są podane w nawiasach w formacie „Headgroup(sn1/sn2)” (np. PC(16:0/18:1(9Z)). Domyślnie zakładana jest stereochemia R przy węglu C-2 glicerolu i przyłączenie grupy nagłówkowej w pozycji sn3. Domyślnie zakładane są również łańcuchy acylowe. Przedrostek „O-” jest używany do wskazania obecności podstawnika eteru alkilowego, np. PC(O-16:0/18:1(9Z)), podczas gdy przedrostek „P-” jest używany dla podstawnika eteru 1Z-alkenylowego (plazmalogenu), np. PC(P-16:0/18:1(9Z)).
Dla cząsteczek o przeciwnej (S) stereochemii w C2 grupy glicerolowej i przyłączeniu grupy głównej w pozycji sn1, do skrótu dodaje się specyfikację stereochemii of. Stosowany jest format skrótu „Headgroup(sn3/sn2)”.
W przypadku cząsteczek o nieznanej stereochemii przy węglu C-2 grupy glicerolowej do skrótu dodawana jest specyfikacja stereochemii of, a struktura jest rysowana ze stereochemią C-2 nieokreśloną.

.

Articles

Dodaj komentarz

Twój adres e-mail nie zostanie opublikowany.