Kluczową różnicą między snRNA a snRNP jest to, że snRNA są małymi jądrowymi cząsteczkami RNA, podczas gdy snRNP lub małe jądrowe rybonukleoproteiny są małymi jądrowymi cząsteczkami RNA z białkami.
snRNA są niekodującymi, biologicznie aktywnymi małymi cząsteczkami RNA o średnim rozmiarze 150 nukleotydów. W stanie naturalnym występują zwykle w asocjacji z białkami jako snRNPs. SnRNPs są zatem małymi jądrowymi RNA z kilkoma białkami specyficznymi dla snRNPs. SnRNPs są zaangażowane w pośredniczenie lub regulację potranslacyjnych procesów przetwarzania RNA, takich jak splicing, itp. Zarówno snRNA jak i snRNP znajdują się w jądrze komórek eukariotycznych.
KONTENCJE
1. Przegląd i najważniejsze różnice
2. Co to jest snRNA
3. Co to jest snRNP
4. Podobieństwa między snRNA i snRNP
5. Porównanie obok siebie – snRNA vs snRNP w formie tabelarycznej
6. Podsumowanie
Co to jest snRNA?
snRNA oznacza małe jądrowe RNA. Są to małe jądrowe cząsteczki RNA znajdujące się w wypustkach splicingowych i ciałkach Cajala w jądrze komórkowym w komórkach eukariotycznych. Cz±steczka snRNA ma ¶redni± długo¶ć 150 nukleotydów. Te snRNA są transkrybowane przez pol II i pol III. Główną funkcją snRNA jest przetwarzanie pre-messenger RNA (hnRNA) w jądrze. Są one głównie zaangażowane w pośredniczenie lub regulację procesów posttranslacyjnych RNA, takich jak splicing. Dzięki działaniu snRNA dochodzi do precyzyjnego wyrównania i prawidłowego wycięcia intronów. Ponadto snRNA biorą udział w regulacji czynników transkrypcyjnych (7SK RNA) lub polimerazy RNA II (B2 RNA) oraz utrzymaniu telomerów.
Rysunek 01: snRNA
snRNA są niekodującymi RNA. Należą do klasy bardzo obfitych biologicznie aktywnych RNA zlokalizowanych w jądrze komórkowym. Są one zawsze związane z cząsteczkami białek i występują jako małe jądrowe rybonukleoproteiny (snRNP). Wyróżnia się dwa główne typy snRNA: snRNA klasy Sm i snRNA klasy Lsm. U1, U2, U4, U4atac, U5, U7, U11, i U12 są snRNA klasy Sm, podczas gdy U6 i U6atac są snRNA klasy Lsm.
Co to jest snRNP?
snRNP jest małą jądrową cząsteczką RNA połączoną z białkami. Ogólnie rzecz biorąc, każdy snRNP zawiera pojedynczy snRNA i wiele cząsteczek białka. Dlatego snRNP to małe jądrowe cząsteczki RNA i białka. snRNP, wraz z wieloma innymi dodatkowymi białkami, tworzą kompleks zwany spliceosomem, w którym odbywa się splicing RNA. snRNP potrzebują zarówno części RNA, jak i części białkowej do splicingu intronów. Komponent RNA jest odpowiedzialny za cięcia endonukleazowe, ponieważ posiada aktywność enzymatyczną. Istnieją różne typy snRNPs i tną one w różnych miejscach.
Rysunek 02: snRNP w Spliceosomie
Oprócz splicingu, snRNP uczestniczą w dojrzewaniu jądrowym pierwotnych transkryptów w mRNA, regulacji ekspresji genów, donorze splice w systemach niekanonicznych oraz w 3′-końcowym przetwarzaniu histonowego mRNA zależnego od replikacji. Istnieją dwie specjalne grupy snRNPs jako małe jąderkowe RNPs (snoRNPs) i małe Cajal-body RNPs (scaRNPs).
Jakie są podobieństwa między snRNA i snRNP?
- Zarówno snRNA, jak i snRNP mają małe jądrowe cząsteczki RNA.
- SnRNA łączą się z białkami, tworząc snRNP.
- Każdy snRNP zawiera pojedynczy snRNA.
- Zarówno snRNA, jak i snRNP występują w jądrze komórek eukariotycznych.
Jaka jest różnica między snRNA i snRNP?
snRNA to mała niekodująca cząsteczka RNA zlokalizowana w jądrze komórki eukariotycznej, natomiast snRNP to kompleks pojedynczego snRNA i białek specyficznych dla snRNP. SnRNPS to małe jądrowe cząsteczki rybonukleoproteinowe. snRNA to po prostu mała cząsteczka RNA, podczas gdy snRNP to kompleks cząsteczki snRNA i ściśle związanych z nią białek. Jest to więc kluczowa różnica między snRNA a snRNP.
Poniższa infografika przedstawia różnice między snRNA a snRNP w formie tabelarycznej.
Podsumowanie – snRNA vs snRNP
snRNA to klasa niekodujących małych jądrowych RNA zlokalizowanych w jądrze eukariotycznym. Pełnią one ważne funkcje związane ze splicingiem intronów i innymi procesami przetwarzania RNA. W stanie naturalnym snRNA jest związany z białkami i występuje jako małe jądrowe cząsteczki rybonukleoproteinowe (snRNPs). snRNPs, wraz z wieloma innymi białkami, są zaangażowane w tworzenie kompleksu spliceosomu w celu przeprowadzenia splicingu RNA. Tak więc, to podsumowuje różnicę między snRNA i snRNP.
Referencja:
1. Stone, Lauren B, and Kasandra J Riley. „Small Nuclear Ribonucleoproteins (SnRNPs).” Wiley Online Library, American Cancer Society, 15 Aug. 2014, onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/9780470015902.a0005038.
2. „Small Nuclear RNA. „ScienceDirect Topics, Available here.
Image Courtesy:
1. „RF00003” – z bazy danych Rfam (Public Domain) via Commons Wikimedia
2. „Spliceosome ball cycle new2” By JBrain – (CC BY-SA 2.0 de) via Commons Wikimedia
.