Krzywa topnienia kwasu nukleinowego pokazująca hiperchromiczność w funkcji temperatury
Pomiar absorpcji światła jest ważny w monitorowaniu topnienia i annealingu DNA. W temperaturze topnienia (Tm), DNA jest w połowie zdenaturowane, a w połowie dwuniciowe. Obniżając temperaturę poniżej Tm, zdenaturowane nici DNA będą z powrotem anneal do podwójnej nici DNA. Kiedy temperatura jest powyżej Tm, DNA jest denaturowany.
Because topnienia występuje niemal natychmiast w pewnej temperaturze, monitorowanie absorbancji DNA w różnych temperaturach wskazywałoby na temperaturę topnienia. Będąc w stanie znaleźć temperaturę, w której DNA topi się i annealed, naukowcy są w stanie oddzielić pasma DNA i anneal je z innymi pasmami DNA. Jest to ważne przy tworzeniu hybrydowego DNA, które składa się z dwóch nici DNA pochodzących z różnych źródeł. Ponieważ nici DNA mogą ulec wyżarzeniu tylko wtedy, gdy są do siebie podobne, tworzenie hybrydowych DNA może wskazywać na podobieństwa między genomami różnych organizmów.