Il trasporto ciclico di elettroni intorno al fotosistema I genera ATP senza accumulo di NADPH nei cloroplasti. Nelle angiosperme, il trasporto di elettroni consiste in una via dipendente dalla proteina PGR5-PGRL1 e in una via dipendente dal complesso NADH deidrogenasi-like dei cloroplasti. Molto probabilmente, la via PGR5-PGRL1 corrisponde alla fosforilazione ciclica scoperta da Arnon e contribuisce principalmente alla formazione di ΔpH nella fotosintesi. La sintesi dell’ATP utilizza questo ΔpH formato dal trasporto ciclico di elettroni sia lineare che PSI. Inoltre, l’acidificazione del lume del tilakoide abbassa l’utilizzo dell’energia luminosa nel fotosistema II e anche il trasporto di elettroni attraverso il complesso del citocromo b6f. In assenza di PGR5, il NDH del cloroplasto compensa in una certa misura la ridotta formazione di ΔpH. Inoltre, la conducibilità protonica è aumentata, probabilmente attraverso l’ATPasi, nei mutanti pgr5. Il macchinario fotosintetico forma probabilmente una rete complessa per mantenere un’elevata attività fotosintetica in condizioni di luce fluttuante.