Restoration
A Yellowstone’s Native Fish Conservation Plan (2010) célkitűzései közé tartozik a Yellowstone-tó őshonos halainak állományának helyreállítása a tóban az 1990-es évek végén dokumentált szintre, a Yellowstone-tó 59 történelmi ívó mellékfolyója közül legalább 45-ben az ívó YCT hozzáférésének fenntartása, valamint a genetikailag tiszta YCT fenntartása vagy helyreállítása a tiszta vagy hibrid YCT által elfoglalt patakok jelenlegi kiterjedésében.
Lamar River
Mivel a Lamar folyó főfolyójában nincsenek akadályok a halak folyásirányú vándorlása előtt, az 1930-as években telepített szivárványos pisztráng leszármazottai a vízgyűjtő terület számos pontján elterjedtek és hibridizálódtak a vágófejű pisztránggal. A genetikai elemzések azt mutatják, hogy a Lamar folyó forrásvidéki szakaszán élő vágófejű pisztrángok genetikailag változatlanok maradtak.
A megmaradt Yellowstone vágófejű pisztrángok védelme érdekében az NPS szelektív eltávolítást hajtott végre. A Lamar folyó hídjától felfelé minden kifogott szivárványos pisztrángra vonatkozóan 2014-ben kötelező halpusztítási szabályozást vezettek be. Jelenleg a szabályozás szerint minden nem őshonos halat és a Knowles-vízeséstől felfelé minden nem őshonos halat és azonosítható vízililiom x szivárványos pisztráng hibridet le kell ölni. A Lamar-völgyön keresztül 2013 óta évente szelektív, elektromos halászattal történő eltávolítást végeznek. 2019-ben a Lamar folyó kanyonjától felfelé az elektromos halászat során vett minták 7%-át szivárványos vagy hibrid pisztrángnak minősítették. Ez az alacsony arány szöges ellentétben áll a kanyontól lefelé végzett munkával.
2015-ben a Lamar folyó hídjától lefelé 136 halból vettek mintát. A helyszíni azonosítás alapján a halak 48%-a Yellowstone vágópisztráng, 19%-a szivárványos pisztráng, 31%-a pedig hibrid volt. E halak többségét rádiójeladókkal vagy passzív integrált transzponder (PIT) címkékkel jelölték meg egy folyamatban lévő kutatási projekt részeként, amelynek célja annak meghatározása, hogy a Yellowstone cutthroat, a szivárványos és a hibrid pisztrángok ugyanazokat a területeket használják-e ívásra és az ívás időzítésére, valamint a gazdálkodási intézkedésekhez való tájékozódás érdekében.
Slough Creek
A Slough Creek-ben az elmúlt évtizedben egyre gyakrabban találtak szivárványos-pisztráng hibrideket. A Lamar folyótól eltérően a Slough Creek kisebb, és a halak felfelé irányuló mozgását akadályozó gátat építettek. Mivel a gát megvan, és a szivárványos pisztrángok már nem juthatnak be a rendszerbe, a meglévő szivárványos és hibrid pisztrángokat horgászattal és elektromos horgászattal történő eltávolítással lehet hatékonyan kezelni.
Soda Butte Creek
A Soda Butte Creekben a park határán kívül telepedett meg a pisztráng, és a 2000-es évek elején terjedt el a park vizeiben. Kezdetben a patakpisztrángot a Montana állambeli Cooke Citytől felfelé a bányaszennyezés által létrehozott kémiai gát elszigetelte a forrásvízben. Amikor a bányahulladékot lefedték és a vízminőség javult, a pataki pisztráng lefelé vándorolt, és elkezdte negatívan befolyásolni a vágófejű pisztrángot.
Közel két évtizeden keresztül az ügynökségek közötti elektromos horgászattal végzett felmérések elegendőek voltak ahhoz, hogy a pataki pisztráng populációkat alacsonyan tartsák, de nem akadályozták meg az elterjedési terület kiterjesztését. Idővel a pataki pisztráng lefelé terjedt, és veszélyt jelentett a Lamar folyóra. Emellett az Ice Box Canyontól felfelé továbbra is szivárványos pisztráng hibridizációját mutatták ki a vágóhasú pisztrángoknál.
2013-ban az Ice Box Falls vízesést úgy módosították, hogy teljes akadályt képezzen a halak felfelé irányuló mozgása előtt, így teljesen megszüntették a nem őshonos halak felfelé vándorlásának veszélyét. A 2015-ös kémiai kezelés során közel 450 pataki pisztrángot távolítottak el. A 2016-os második kezelés során mindössze két pataki pisztrángot gyűjtöttek be a Soda Butte Creekből. A 2017 óta végzett eDNS- és elektrohorgászati mintavételek, valamint az elektrohorgászati felmérések nem találtak nyomát pataki pisztrángnak a rendszerben. Ez jól jelzi, hogy a vízgyűjtőben teljes pusztulást értek el.
Elk Creek Complex
Az Elk Creek-ben természetes vízeséses gát található, közvetlenül a Yellowstone-folyóval való összefolyása előtt. A vízesés megakadályozta, hogy a halak természetes módon benépesítsék a rendszert, ezért az Elk, Lost és Yancey patakok patakegyüttese (Elk Creek Complex) halmentes volt, amikor az 1920-as évek elején először telepítettek vágófejű pisztrángot. 1942-ben a patakokba patakpisztrángot telepítettek, ami a harcsafélék teljes elvesztését eredményezte.
Az Elk Creek komplexumot 2012 és 2014 között évente rotenonnal kezelték a patakpisztráng eltávolítása érdekében. Miután megtisztították a patakpisztrángoktól, megkezdődött az őshonos Yellowstone vágópisztráng visszatelepítése. Az Antelope és a Pebble patakok szolgáltatták a halakat az Elk Creek Complex 2015 októberében végrehajtott telepítéséhez. További telepítésekre 2016-ban és 2017-ben került sor. A természetes szaporodást 2017-ben is dokumentálták az elektromos horgászattal végzett felmérések során.