Kapcsolatok Pakisztánhoz
Mivel a bizonyítékok arra utalnak, hogy a támadások Pakisztán területén történtek, India 2008. november 28-án kérte Ahmed Shuja Pasha altábornagy, a pakisztáni hírszerzés főigazgatójának jelenlétét a nyomozás megkezdésekor. Pakisztán először beleegyezett ebbe a kérésbe, de később visszakozott, és felajánlotta, hogy maga Pása helyett a főigazgató helyett egy képviselőt küld Indiába. A támadások azonnali hatása a két ország között folyamatban lévő békefolyamatra volt érezhető. A pakisztáni hatóságok terrorista elemekkel szembeni tétlenségét állítva Pranab Mukherjee, India külügyminisztere kijelentette: “Ha nem cselekszenek, akkor nem lesz üzlet a szokásos módon”. India később lemondta krikettcsapatának 2009. január-februárra tervezett pakisztáni körútját.
India kísérletét, hogy nyomást gyakoroljon Pakisztánra a határain belüli terroristák elleni fellépés érdekében, a nemzetközi közösség határozottan támogatta. Condoleezza Rice amerikai külügyminiszter és Gordon Brown brit miniszterelnök a mumbai merényleteket követően Indiát és Pakisztánt is bejárta. Az alapvetően “konfliktusmegelőzési” gyakorlatnak tekintett diplomáciai tevékenység során amerikai és más tisztviselők sürgette a pakisztáni polgári kormányt, hogy lépjen fel a támadásokban való részvétellel gyanúsítottak ellen. Félő volt, hogy a feszültségek eszkalálódhatnak a két atomfegyverekkel rendelkező szomszéd között. India azonban tartózkodott attól, hogy csapatokat vezényeljen a pakisztáni határhoz, ahogyan tette azt a 2001. december 13-i, az indiai parlament elleni támadást követően, amelyet szintén pakisztáni fegyveresek hajtottak végre. Ehelyett India a nemzetközi közvélemény támogatásának kiépítésére összpontosított különböző diplomáciai csatornákon és a médián keresztül. India szankciókat kért az ENSZ Biztonsági Tanácsától a Jamaat-ud-Dawa ellen, azt állítva, hogy a csoport a Lashkar-e-Taiba fedőszervezete, amelyet Pakisztán 2002-ben betiltott. India kérésének eleget téve a Biztonsági Tanács 2008. december 11-én szankciókat vezetett be a Jamaat-ud-Dawa ellen, és a csoportot hivatalosan is terrorista szervezetnek nyilvánította.
Pakisztán azt állította, hogy 2008. december 8-án letartóztatta Zaki-ur-Rehman Lakhvit, a Lashkar-e-Taiba egyik magas rangú vezetőjét és a mumbai támadások feltételezett kitervelőjét. A pakisztáni biztonsági erők országszerte rajtaütéseket hajtottak végre a Jamaat-ud-Dawa irodáiban. Ez a razzia azonban csak néhány napig tartott, majd a Jamaat-ud-Dawa irodái körül felállított biztonsági kordonokat feloldották. Yousaf Raza Gillani pakisztáni miniszterelnök kijelentette, hogy a Jamaat-ud-Dawa tevékenységét nem szabad megakadályozni, mivel “emberek ezrei részesülnek” a csoport “jóléti tevékenységeiből”. Pakisztán továbbá fenntartotta, hogy India nem szolgáltatott elegendő bizonyítékot számos feltételezett terroristával szemben, és hogy e gyanúsítottakkal szemben csak akkor lehetett volna fellépni, ha ezeket a bizonyítékokat “a média helyett diplomáciai csatornákon” szolgáltatták volna. Pakisztán elutasította India azon követelését, hogy adjon ki 20 személyt, akik állítólag részt vettek több, indiai területen elkövetett terrortámadásban. A 2011-es tárgyalásán Headley azonban részletes tanúvallomást tett mind a Lashkar-e-Taiba, mind a pakisztáni hírszerző ügynökség részvételéről a mumbai támadásokban.