Den vigtigste forskel mellem snRNA og snRNP er, at snRNA’er er små nukleare RNA-molekyler, mens snRNP’er eller små nukleare ribonukleoproteiner er små nukleare RNA-molekyler med proteiner.
snRNA’er er ikke-koderende, biologisk aktive små RNA-molekyler med en gennemsnitlig størrelse på 150 nukleotider. De er normalt til stede i forbindelse med proteiner som snRNP’er i naturlig tilstand. SnRNP’er er således små nukleare RNA’er med flere snRNP-specifikke proteiner. snRNP’er er involveret i formidling eller regulering af posttranslationelle RNA-processeringshændelser som f.eks. splejsning osv. Både snRNA og snRNP findes i kernen af eukaryote celler.
KONTINGENTER
1. Oversigt og hovedforskel
2. Hvad er snRNA
3. Hvad er snRNP
4. Ligheder mellem snRNA og snRNP
5. Sammenligning side for side – snRNA vs. snRNP i tabelform
6. Sammenfatning
Hvad er snRNA?
snRNA står for small nuclear RNA. De er små nukleare RNA-molekyler, der findes i splejsepletterne og Cajal-legemerne i cellekernen i eukaryote celler. Et snRNA-molekyle har en gennemsnitlig længde på 150 nukleotider. Disse snRNA’er transskriberes af pol II og pol III. SnRNA’s hovedfunktion er behandling af pre-messenger RNA (hnRNA) i kernen. De er hovedsagelig involveret i formidling eller regulering af posttranslationelle RNA-bearbejdningsbegivenheder som f.eks. splejsning. På grund af snRNA’ernes virkning sker der en præcis tilpasning og en korrekt excision af introner. Desuden deltager snRNA’er i reguleringen af transkriptionsfaktorer (7SK RNA) eller RNA-polymerase II (B2 RNA) og opretholdelse af telomerer.
Figur 01: snRNA
snRNA’er er ikke-kodende RNA’er. De tilhører en klasse af meget hyppigt forekommende biologisk aktive RNA, der er lokaliseret i kernen. De er altid associeret med proteinmolekyler og findes som små nukleare ribonukleoproteiner (snRNP). Der findes to hovedtyper af snRNA’er, nemlig Sm-klassen snRNA og Lsm-klassen snRNA. U1, U2, U4, U4atac, U5, U7, U11 og U12 er Sm-klasse snRNA, mens U6 og U6atac er Lsm-klasse snRNA.
Hvad er snRNP?
snRNP er et lille nukleært RNA-molekyle, der er kombineret med proteiner. Generelt indeholder hvert snRNP et enkelt snRNA og mange proteinmolekyler. Derfor er snRNP’er små nukleare RNA-molekyler og proteiner. snRNP’er danner sammen med mange andre ekstra proteiner det kompleks, der kaldes spliceosom, hvor RNA-splejsning finder sted. snRNP’er har brug for både RNA-delen og proteindelen for at splejse introner ud. RNA-delen er ansvarlig for endonukleaseklipningerne, da den har enzymatisk aktivitet. Der findes forskellige typer af snRNPs, og de skærer forskellige steder.
Figur 02: snRNP i splejsosom
Ud over splejsning deltager snRNP’er i nukleær modning af primære transkriptioner i mRNA’er, regulering af genekspression, splejsedonor i ikke-kanoniske systemer og i 3′-end-processering af replikationsafhængige histon-mRNA’er. Der findes to særlige grupper af snRNP’er som små nukleolære RNP’er (snoRNP’er) og små Cajal-body RNP’er (scaRNP’er).
Hvad er lighederne mellem snRNA og snRNP?
- Både snRNA og snRNP har små nukleare RNA-molekyler.
- snRNA’er kombineres med proteiner for at danne snRNP’er.
- Hvert snRNP indeholder et enkelt snRNA.
- Både snRNA og snRNP findes i kernen i eukaryote celler.
Hvad er forskellen mellem snRNA og snRNP?
snRNA er et lille ikke-kodende RNA-molekyle, der er lokaliseret i den eukaryote cellekerne, mens snRNP er et kompleks af et enkelt snRNA og snRNP-specifikke proteiner. snRNPS er små nukleare ribonukleoproteinpartikler. snRNA er blot et lille RNA-molekyle, mens snRNP er et kompleks af et snRNA-molekyle og tæt bundne proteiner. Dette er altså den vigtigste forskel mellem snRNA og snRNP.
Nedenstående infografik viser forskellene mellem snRNA og snRNP i tabelform.
Summarum – snRNA vs. snRNP
snRNA er en klasse af ikke-kodende små nukleare RNA, der er lokaliseret i den eukaryote kerne. De opfylder vigtige funktioner i forbindelse med intronsplejning og anden RNA-behandling. I naturlig tilstand er snRNA associeret med proteiner og findes som små nukleare ribonukleoproteinpartikler (snRNPs). snRNPs er sammen med mange andre proteiner involveret i dannelsen af spliceosomkomplekset med henblik på at udføre RNA-splejsning. Dette opsummerer således forskellen mellem snRNA og snRNP.
Reference:
1. Stone, Lauren B, og Kasandra J Riley. “Små nukleare ribonukleoproteiner (SnRNP’er).” Wiley Online Library, American Cancer Society, 15 Aug. 2014, onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/9780470015902.a0005038.
2. “Small Nuclear RNA.” ScienceDirect Topics, Available here.
Image Courtesy:
1. “RF00003” – fra Rfam-databasen (Public Domain) via Commons Wikimedia
2. “Spliceosome ball cycle new2” Af JBrain – (CC BY-SA 2.0 de) via Commons Wikimedia