Constructorul ChisinauRediger
Mandskabet blev grundlagt i 1992 som Constructorul Chisinau og spillede i Chisinau, den moldoviske hovedstad. Det kom ind i den moldoviske nationale division i 1995-96-sæsonen. Constructorul vandt deres første sølvtøj, den moldoviske pokal i 1996 med en 2-1-sejr over Tiligul Tiraspol, og i den følgende sæson vandt de deres eneste moldoviske nationale divisionstitel ved at nægte byrivalerne Zimbru Chișinău deres sjette triumf i træk. Liga-triumfen gav Constructorul en plads i UEFA Champions League i 1997-98, hvor de blev slået ud af den hviderussiske klub MPKC Mozyr med 4-3 efter samlet resultat i den første kvalifikationsrunde. I 2000 vandt Constructorul sin anden pokal ved at slå Zimbru 1-0 i finalen den 24. maj.
Klubben deltog også i UEFA Cup’en i Constructorul-æraen. I september 2000 blev klubben udelukket fra at deltage i europæiske turneringer i et år efter en række sikkerhedsbrister i en hjemmekamp mod det bulgarske hold CSKA Sofia.
Den første formand for FC Tiraspol var Valeriu Rotari (1947-2000), en forretningsmand, der blev anklaget for aktiviteter i forbindelse med organiserede kriminelle bander. Takket være Rotari lykkedes det klubben at opnå sine første titler i den nationale division. Mordet på Rotari den 16. februar 2000 var en af grundene til, at klubbens videre præstationer var meget dårligere end i 1990’erne.
Flytning til TransnistrienRediger
For sæsonen 2001-02 flyttede klubben til Cioburciu, en lille landsby uden for Tiraspol, hovedstaden i udbryderrepublikken Transnistrien, og blev omdøbt til Constructorul Cioburciu. I den følgende sæson flyttede klubben ind i Tiraspol og blev til sin nuværende enhed. Klubben har ikke vundet en pokal- eller nationaldivisionstitel, siden den forlod Chisinau.
Den eneste større europæiske kampagne, siden den forlod Chisinau, var UEFA Cup’en i 2004-05. Klubben besejrede det armenske hold Shirak i den første kvalifikationsrunde (4-1 samlet), inden man i næste runde blev slået ud med 5-1 samlet af Metalurh Donetsk fra Ukraine.