Cyklický elektronový transport kolem fotosystému I generuje ATP bez akumulace NADPH v chloroplastech. U nahosemenných rostlin se elektronový transport skládá z dráhy závislé na proteinu PGR5-PGRL1 a dráhy závislé na komplexu podobném chloroplastové NADH dehydrogenáze. Dráha PGR5-PGRL1 s největší pravděpodobností odpovídá cyklické fosforylaci objevené Arnonem a přispívá především k tvorbě ΔpH při fotosyntéze. Syntéza ATP využívá tento ΔpH vytvořený lineárním i cyklickým transportem elektronů PSI. Okyselení thylakoidního lumen navíc snižuje využití světelné energie ve fotosystému II a také transport elektronů prostřednictvím komplexu cytochromu b6f. V nepřítomnosti PGR5 chloroplastová NDH do určité míry kompenzuje sníženou tvorbu ΔpH. Kromě toho je u mutantů pgr5 zvýšena protonová vodivost, pravděpodobně prostřednictvím ATPázy. Fotosyntetický aparát pravděpodobně tvoří komplexní síť, která udržuje vysokou aktivitu fotosyntézy za kolísavých světelných podmínek.
.