2-mikron plasmidet i Saccharomyces cerevisiae er et relativt lille multi-kopieret egoistisk DNA-element, der befinder sig i gærens kerne med et kopiantal på 40-60 pr. haploid celle. Plasmiden er i stand til at bestå i værtspopulationer med næsten kromosomlignende stabilitet ved hjælp af et partitioneringssystem og et system til kontrol af antallet af kopier. Første del af denne artikel beskriver egenskaberne ved partitioneringssystemet, der består af to plasmidkodede proteiner, Rep1 og Rep2, og et partitioneringslokus STB. De nuværende beviser understøtter en model, hvor Rep-STB-systemet kobler plasmidseparation til kromosomseparation ved at fremme den fysiske tilknytning af plasmidmolekyler til kromosomer. I anden del fokuseres der på det Flp-stedspecifikke rekombinationssystem, som plasmidet rummer, og som spiller en afgørende rolle for opretholdelsen af et stabilt plasmidkopiantal. Flp-systemet korrigerer ethvert fald i plasmidpopulationen ved at fremme plasmidamplifikation via en rekombinationsinduceret rolling circle-replikationsmekanisme. En passende plasmidamplifikation, uden at antallet af kopier stiger uhæmmet, sikres ved positiv og negativ regulering af FLP-genekspressionen ved hjælp af plasmidkodede proteiner og ved kontrol af Flp-niveauet/aktiviteten ved hjælp af posttranslationel modifikation af Flp ved hjælp af det cellulære sumoylationssystem. Flp-systemet er blevet anvendt med succes til at forstå mekanismerne for stedsspecifik rekombination og til at skabe målrettede genetiske ændringer med henblik på at løse grundlæggende problemer i biologien og til at nå biotekniske mål. En særlig interessant og måske mindre kendt og undervurderet anvendelse af Flp-systemet til at afsløre unikke DNA-topologier, der er nødvendige for at give DNA-protein-maskinerne funktionel kompetence, drøftes her.