Als de antibacteriële activiteit van PHMB (Fig. 1a) te wijten is aan membraanverstoring, zoals algemeen gerapporteerd6,7,8,9,10 , zou verwacht worden dat het de bacteriële celbarrières permeabiliseert bij groeiremmende en subgroeiremmende concentraties. Om dit model te testen, hebben we eerst de minimale remmende concentraties (MIC) en de tijddodende eigenschappen voor PHMB tegen Escherichia coli (stammen K-12 en MG1655) en Salmonella enterica serovar Typhimurium (stam LT2) vastgesteld. Zoals eerder gerapporteerd2,4, vertoonde PHMB krachtige groeiremmende en cidale eigenschappen (supplementaire tabel 2 en supplementaire fig. 1). Na de behandeling onderzochten we de cellen ook met lichtmicroscopie. Onverwacht bleek dat groeiremmende concentraties PHMB de cellen niet logen, zoals gecontroleerd met helderveldmicroscopie. Om schade aan de celbarrière te beoordelen die onzichtbaar zou kunnen zijn voor microscopie, werden E. coli K-12-culturen gekweekt tot de middenlogfase, behandeld met PHMB in aanwezigheid van de fluorescerende probe voor membraanintegriteit SYTOX®Green en vervolgens gevolgd met fluorimetrie. Deze probe is nuttig als indicator voor membraanschade, omdat hij normaal gesproken door intacte bacteriën wordt uitgesloten en de fluorescentiekwantumopbrengst toeneemt bij DNA-binding. Daarom wordt verwacht dat intacte bacteriën een lage fluorescentie vertonen en dat de fluorescentie toeneemt na beschadiging van de celbarrière16. Zoals verwacht vertoonden vers gekweekte E. coli culturen een grote toename in fluorescentie na behandeling met de bekende celwandverstoorder polymyxine B of warmtebehandeling (Fig. 1b). Onverwacht resulteerde PHMB behandeling in relatief lagere fluorescentieniveaus. Het meest opvallend is dat hogere concentraties PHMB resulteerden in fluorescentie op achtergrondniveau. Deze waarnemingen zijn niet verenigbaar met membraanverstoring als het belangrijkste antibacteriële mechanisme en riepen daarom verdere twijfel op over het gevestigde model.
PHMB gaat bacteriën binnen
Als het primaire doelwit van PHMB niet de bacteriële celbarrières zijn, of niet uitsluitend celbarrières, dan werkt het waarschijnlijk intern en dit zou cel-ingang vereisen. Om te testen of bacteriën binnendringen, hebben we een PHMB-FITC-conjugaat gesynthetiseerd (aanvullende fig. 2a,b) en de opname in Gram-positieve (Staphylococcus aureus), Gram-negatieve (Escherichia coli en Salmonella enterica serovar Typhimurium) en zuurvaste (Mycobacterium smegmatis) bacteriën geëvalueerd met behulp van microscopie en flowcytometrie (fig. 1c, aanvullende fig. 3). Sterke celgeassocieerde groene fluorescentie werd waargenomen bij alle geteste soorten (Fig. 1c). Om de cellokalisatie grondiger te onderzoeken, werd de grote bacterie Bacillus megaterium behandeld met PHMB-FITC, tegengekleurd met membraanlokaliserende tarwekiemagglutinine (WGA-rood) en onderzocht met fluorescentiemicroscopie (Fig. 1d). Celintrede werd waargenomen in zowel levende als gefixeerde cellen en een analyse van het fluorescentie-intensiteitsprofiel toont aan dat PHMB-FITC gelokaliseerd werd binnen het cytoplasma, zonder accumulatie aan de celbarrière (Fig. 1e).
De waarneming dat PHMB cellen binnendringt bij lage microgram/mL concentraties suggereert dat het levende cellen kan binnendringen. Om te onderzoeken of voor de opname van PHMB in bacteriën energiemetabolisme nodig is, werden E. coli-culturen in de middenfase gedurende 2 uur bij 37 °C of 4 °C geïncubeerd om het cellulaire ATP-niveau te verlagen. Vervolgens werden de cellen behandeld met PHMB-FITC (0-6 μg/ml) en verder geïncubeerd op ijs gedurende 2 uur. Cel-geassocieerde PHMB-FITC fluorescentie werd gekwantificeerd door fluorimetrie (Supplementary Fig. 3b). Cellen gehouden bij 4 ° C vertoonden een verminderde PHMB-FITC-opname ten opzichte van cellen geïncubeerd bij 37 ° C, consistent met een energie-afhankelijke cel opnameproces. Ook werden groen fluorescerende en beweeglijke bacteriën waargenomen op verschillende tijdstippen tijdens PHMB behandeling (Supplementary Fig. 3). Omdat bacteriële motiliteit energieafhankelijk is17 , wijst dit erop dat PHMB-FITC in metabolisch actieve cellen terechtkomt. Daarom komt PHMB diverse bacteriën binnen en werd binnenkomst waargenomen in beweeglijke cellen.
PHMB arresteert celdeling en condenseert bacteriële chromosomen
Bij microscopisch onderzoek van E. coli merkten we op dat met PHMB behandelde cellen vaak een langgerekte morfologie vertoonden, wat kenmerkend kan zijn voor remming van de celdeling (Fig. 2a). Om het effect van PHMB op celstrekking te meten, titreerden we PHMB in groeiende culturen van E. coli stam SS996 (vide infra) en maten we de cellengte. Bij groeiremmende concentraties verlengde meer dan 80% van de cellen (Fig. 2b; supplementaire tabel 2). Ook zagen we dat E. coli behandeld met groeiremmende concentraties PHMB of PHMB-FITC gevolgd door DAPI-kleuring blauw fluorescerende foci in de buurt van het celcentrum vertoonden (Fig. 2c). Deze structuren leken op nucleoïden18. Om visualisatie van het DNA foci vergemakkelijken, genereerden we filamenteuze / gemultinucleerde populaties van E. coli door remming van de celdeling door RNA silencing van de essentiële celdeling gen ftsZ 19. RNA silencing werd gekozen voor dit experiment omdat het specifieke en controleerbare onderdrukking van de vertaling van essentiële gen transcripten mogelijk maakt20. Genen die essentieel zijn voor de groei kunnen niet worden uitgeschakeld met genoomontwrichtingsmethoden, omdat dit zou resulteren in niet-levensvatbare stammen. In afwezigheid van PHMB vertoonden de filamenteuze cellen een uniforme DAPI-kleuring, terwijl de met PHMB behandelde cellen blauwe “kralenstrengen” vertoonden (Fig. 2d). Ook bij de grote Gram-positieve bacterie B. megaterium zagen we met DAPI gekleurde foci na behandeling met PHMB (Fig. 2e). Deze resultaten, in zowel Gram-negatieve als Gram-positieve soorten, tonen aan dat blootstelling aan PHMB leidt tot gecondenseerde chromosomen binnen bacteriën.