LIPID MAPS® グリセロリン脂質の略号 (GP)
LIPID MAPS® グリセロリン脂質略号 (PC, PE, etc.) はこちら。) は、側鎖の構造が ‘Headgroup(sn1/sn2)’ 形式で括弧内に示されている1つまたは2つのラジル側鎖を持つ種を指すためにここで使われています (例: PC(16:0/18:1(9Z))). デフォルトでは、グリセロールのC-2炭素でのR立体化学とsn3位置でのヘッドグループの付着が仮定されています。 また、アシル鎖もデフォルトで想定されています。 O- はアルキルエーテル置換基の存在を示し、PC(O-16:0/18:1(9Z))のように1Z-アルケニルエーテル(プラズマローゲン)置換基の場合はP-が使われます(PC(P-16:0/18:1(9Z))など)。
グリセロール基のC2が反対(S)の立体化学で、sn1の位置にヘッドグループが付く分子の場合、略号の後ろにofの立体化学の指定が付きます。 Headgroup(sn3/sn2)」という略号形式を用いる。
グリセロール基のC-2炭素の立体化学が不明な分子については、略号にstereochemistry designation ofを付加し、C-2立体化学は未指定で構造を描く。

Articles

コメントを残す

メールアドレスが公開されることはありません。