気管食道瘻を持つ成人患者の治療方法は、瘻孔が先天性か後天性かにより異なる。 ほとんどの成人は後天性の気管食道瘻を有しており、治療は瘻孔が良性プロセスによるものか悪性腫瘍によるものかによって異なり、後者は通常原発性食道癌である。 良性の気管食道瘻の患者さんでは、ほとんどの場合、まず支持療法を行い、その後、最終的に外科的矯正を行うという治療法がとられます。 一般的には、瘻孔の大きさと気管側の位置により、瘻孔を一次的に修復し、必要であれば気管を切除して再建する外科的治療が行われる。 悪性気管食道瘻の患者については、治療法は、患者が切除可能かどうか、および/または外科療法に医学的に適しているかどうかによる。 しかし、悪性気管食道瘻の患者のほとんどは病気が進行しており、緩和的な手段でしか治療することができない。 悪性気管食道瘻患者に対する現在の緩和療法の標準は、瘻孔を閉鎖することができる被覆自己拡張型金属ステント（SEMS）を内視鏡的または放射線学的に留置することである。 市販されている3種類のカバードSEMSはすべてこの目的に使用され、成功を収めている。 悪性気管食道瘻を有する特定の患者に対する他のあまり一般的でない治療法としては、化学療法および放射線療法、外科的バイパス術、食道排除術、瘻孔切除術および修復術がある。