Keskeinen ero snRNA:n ja snRNP:n välillä on se, että snRNA:t ovat pieniä nukleaarisia RNA-molekyylejä, kun taas snRNP:t eli pienet nukleaariset ribonukleoproteiinit ovat pieniä nukleaarisia RNA-molekyylejä, joissa on proteiineja.
snRNA:t ovat ei-koodaavia, biologisesti aktiivisia, pienempiä RNA-molekyylejä, joiden keskikoko on 150 nukleotidia. Ne esiintyvät luonnontilassa yleensä yhdessä proteiinien kanssa snRNP:nä. Näin ollen snRNP:t ovat pieniä ydin-RNA:ita, joilla on useita snRNP-spesifisiä proteiineja. snRNP:t osallistuvat translaation jälkeisten RNA-prosessointitapahtumien, kuten pilkkomisen, välittämiseen tai säätelyyn. Sekä snRNA että snRNP löytyvät eukaryoottisolujen ytimestä.
YHTEENVETO
1. Yleiskatsaus ja keskeiset erot
2. Mikä on snRNA
3. Mikä on snRNP
4. Samankaltaisuuksia snRNA:n ja snRNP:n välillä
5. Rinnakkaisvertailu – snRNA vs. snRNP taulukkomuodossa
6. Yhteenveto
Mikä on snRNA?
snRNA tarkoittaa pientä ydin-RNA:ta. Ne ovat pieniä nukleaarisia RNA-molekyylejä, joita löytyy eukaryoottisolujen solutumien tuman pilkkujen ja Cajal-kappaleiden sisältä. SnRNA-molekyylin pituus on keskimäärin 150 nukleotidia. Näitä snRNA-molekyylejä transkriboivat pol II ja pol III. SnRNA:n päätehtävä on esivälittäjä-RNA:n (hnRNA) prosessointi ytimessä. Ne osallistuvat pääasiassa translaation jälkeisten RNA-prosessointitapahtumien, kuten pilkkomisen, välittämiseen tai säätelyyn. SnRNA:iden toiminnan ansiosta intronien tarkka kohdistus ja oikeaoppinen poisto tapahtuvat. Lisäksi snRNA:t osallistuvat transkriptiotekijöiden (7SK RNA) tai RNA-polymeraasi II:n (B2 RNA) säätelyyn ja telomeerien ylläpitoon.
Kuva 01: snRNA
snRNA:t ovat ei-koodaavia RNA:ita. Ne kuuluvat luokkaan erittäin runsaita biologisesti aktiivisia RNA:ita, jotka ovat lokalisoituneet ytimeen. Ne liittyvät aina proteiinimolekyyleihin ja ovat olemassa pieninä ydinribonukleoproteiineina (snRNP). SnRNA:ita on kahta päätyyppiä: Sm-luokan snRNA ja Lsm-luokan snRNA. U1, U2, U4, U4atac, U5, U7, U11 ja U12 ovat Sm-luokan snRNA:ita, kun taas U6 ja U6atac ovat Lsm-luokan snRNA:ita.
Mikä on snRNP?
snRNP on proteiineihin yhdistetty pieni nukleaarinen RNA-molekyyli. Yleensä jokainen snRNP sisältää yhden snRNA:n ja useita proteiinimolekyylejä. Näin ollen snRNP:t ovat pieniä ydin-RNA-molekyylejä ja proteiineja. snRNP:t muodostavat yhdessä monien muiden lisäproteiinien kanssa kompleksin nimeltä spliceosomi, jossa RNA:n pilkkominen tapahtuu. snRNP:t tarvitsevat sekä RNA-osaa että proteiiniosaa intronien pilkkomiseen. RNA-osa vastaa endonukleaasileikkauksista, koska sillä on entsymaattista aktiivisuutta. SnRNP:itä on erityyppisiä, ja ne leikkaavat eri kohdissa.
Kuva 02: snRNP spliceosomissa
Splikoinnin lisäksi snRNP:t osallistuvat mRNA:iden primääritranskriptien ydinkypsytykseen, geenien ilmentymisen säätelyyn, ei-kanonisissa systeemeissä tapahtuvaan splice-luovuttajaan ja replikaatiosta riippuvaisten histoni-mRNA:iden 3′-loppuiseen prosessointiin. SnRNP:tä on kaksi erityisryhmää, jotka ovat pienet nukleolaariset RNP:t (snoRNP:t) ja pienet Cajal-kehon RNP:t (scaRNP:t).
Mitä yhtäläisyyksiä snRNA:lla ja snRNP:llä on?
- Kummallakin snRNA:lla ja snRNP:llä on pieni ydinkeskustan RNA-molekyyli.
- snRNA:t yhdistyvät proteiineihin muodostaen snRNP:itä.
- Jokainen snRNP sisältää yhden snRNA:n.
- Kaikki snRNA:t ja snRNP:t sijaitsevat eukaryoottisolujen ytimessä.
Mitä eroa on snRNA:lla ja snRNP:llä?
snRNA on pieni ei-koodaava RNA-molekyyli, joka on lokalisoitunut eukaryoottisolun tumaan, kun taas snRNP on yksittäisen snRNA:n ja snRNP-spesifisten proteiinien muodostama kompleksi. snRNPS ovat pieniä ydinribonukleoproteiinipartikkeleita. snRNA on vain pieni RNA-molekyyli, kun taas snRNP on snRNA-molekyylin ja tiukasti sitoutuneiden proteiinien muodostama kompleksi. Tämä on siis snRNA:n ja snRNP:n keskeinen ero.
Alla olevassa infografiikassa esitetään snRNA:n ja snRNP:n erot taulukkomuodossa.
Yhteenveto – snRNA vs. snRNP
snRNA on luokka ei-koodaavista pienistä nukleaarisista RNA:ista, jotka ovat lokalisoituneet eukaryoottien tumaan. Ne täyttävät tärkeitä intronien liittämiseen ja muuhun RNA:n prosessointiin liittyviä tehtäviä. Luonnollisessa tilassa snRNA liittyy proteiineihin ja esiintyy pieninä ydinribonukleoproteiinipartikkeleina (small nuclear ribonucleoprotein particles, snRNP:t). snRNP:t osallistuvat yhdessä monien muiden proteiinien kanssa spliceosomikompleksin muodostamiseen RNA:n pilkkomisen suorittamiseksi. Tähän tiivistyy siis snRNA:n ja snRNP:n ero.
Viite:
1. Stone, Lauren B ja Kasandra J Riley. ”Pienet ydinribonukleoproteiinit (snRNP:t)”. Wiley Online Library, American Cancer Society, 15 Aug. 2014, onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/9780470015902.a0005038.
2. ”Small Nuclear RNA.” ScienceDirect Topics, Saatavissa täältä.
Image Courtesy:
1. ”RF00003” – Rfam-tietokannasta (Public Domain) kautta Commons Wikimedia
2. ”Spliceosome ball cycle new2” By JBrain – (CC BY-SA 2.0 de) kautta Commons Wikimedia
.