El transporte cíclico de electrones alrededor del fotosistema I genera ATP sin la acumulación de NADPH en los cloroplastos. En las angiospermas, el transporte de electrones consiste en una vía dependiente de la proteína PGR5-PGRL1 y una vía dependiente del complejo NADH deshidrogenasa del cloroplasto. Probablemente, la vía PGR5-PGRL1 corresponde a la fosforilación cíclica descubierta por Arnon y contribuye principalmente a la formación de ΔpH en la fotosíntesis. La síntesis de ATP utiliza este ΔpH formado por el transporte cíclico de electrones tanto lineal como PSI. Además, la acidificación del lumen del tilacoide reduce la utilización de la energía de la luz en el fotosistema II y también el transporte de electrones a través del complejo del citocromo b6f. En ausencia de PGR5, la NDH del cloroplasto compensa hasta cierto punto la formación reducida de ΔpH. Además, la conductividad de protones está regulada, probablemente a través de la ATPasa, en los mutantes de pgr5. Es probable que la maquinaria fotosintética forme una red compleja para mantener una elevada actividad fotosintética bajo condiciones de luz fluctuantes.