El plásmido de 2 micras de Saccharomyces cerevisiae es un elemento de ADN egoísta multicopia relativamente pequeño que reside en el núcleo de la levadura con un número de copias de 40-60 por célula haploide. El plásmido es capaz de persistir en las poblaciones huésped con una estabilidad casi cromosómica con la ayuda de un sistema de partición y un sistema de control del número de copias. La primera parte de este artículo describe las propiedades del sistema de partición que comprende dos proteínas codificadas por el plásmido, Rep1 y Rep2, y un locus de partición STB. Las pruebas actuales apoyan un modelo en el que el sistema Rep-STB acopla la segregación de plásmidos a la segregación de cromosomas promoviendo la asociación física de las moléculas de plásmidos con los cromosomas. En la segunda parte, la atención se centra en el sistema de recombinación específica del sitio Flp alojado en el plásmido, que desempeña un papel fundamental en el mantenimiento del número de copias del plásmido en estado estable. El sistema Flp corrige cualquier disminución de la población de plásmidos promoviendo la amplificación del plásmido a través de un mecanismo de replicación en círculo rodante inducido por la recombinación. La amplificación adecuada del plásmido, sin que aumente el número de copias, está garantizada por la regulación positiva y negativa de la expresión del gen FLP por parte de las proteínas codificadas en el plásmido y por el control del nivel/actividad de Flp a través de la modificación postraduccional de Flp por el sistema de sumoilación celular. El sistema Flp se ha utilizado con éxito para comprender los mecanismos de recombinación específica de un sitio y para producir alteraciones genéticas dirigidas para abordar problemas fundamentales en biología y para lograr objetivos de bioingeniería. Se discute una aplicación particularmente interesante, y tal vez menos conocida y subestimada, de Flp en la revelación de topologías de ADN únicas requeridas para conferir competencia funcional a las máquinas ADN-proteína.