Curva de fusión del ácido nucleico que muestra la hipercromía en función de la temperatura
La medición de la absorción de la luz es importante para controlar la fusión y el recocido del ADN. A la temperatura de fusión (Tm), el ADN está medio desnaturalizado y medio de doble cadena. Si se reduce la temperatura por debajo de la Tm, las hebras de ADN desnaturalizadas volverán a formar una doble cadena de ADN. Cuando la temperatura está por encima de la Tm, el ADN está desnaturalizado.
Debido a que la fusión se produce casi instantáneamente a una determinada temperatura, el control de la absorbancia del ADN a distintas temperaturas indicaría la temperatura de fusión. Al poder encontrar la temperatura a la que el ADN se fundió y se recobró, los científicos pueden separar las cadenas de ADN y recobrarlas con otras cadenas de ADN. Esto es importante para crear ADN híbrido, que consiste en dos cadenas de ADN de diferentes fuentes. Dado que las cadenas de ADN sólo pueden recocer si son similares, la creación de ADNs híbridos puede indicar similitudes entre los genomas de diferentes organismos.