Wiederherstellung
Die Ziele des Yellowstone’s Native Fish Conservation Plan (2010) beinhalten die Wiederherstellung der Abundanz von YCT im See auf den Stand der späten 1990er Jahre, die Aufrechterhaltung des Zugangs für laichende YCT in mindestens 45 der 59 historischen Laichzuflüsse des Yellowstone Lake und die Aufrechterhaltung oder Wiederherstellung genetisch reiner YCT in der aktuellen Ausdehnung der Bäche, die von reinen oder hybriden YCT besetzt sind.
Lamar River
Da es im Hauptstrom des Lamar River keine Hindernisse für die stromaufwärts gerichtete Fischwanderung gibt, haben sich die Nachkommen der in den 1930er Jahren eingesetzten Regenbogenforellen an vielen Stellen des Wassereinzugsgebiets ausgebreitet und mit den Cutthroat-Forellen hybridisiert. Genetische Analysen deuten darauf hin, dass die Cutthroat-Forellen im Oberlauf des Lamar River genetisch unverändert bleiben.
Um die verbleibenden Yellowstone-Cutthroat-Forellen zu schützen, hat der NPS ein selektives Entnahmeverfahren eingeführt. Eine obligatorische Tötungsvorschrift für alle Regenbogenforellen, die flussaufwärts der Lamar River-Brücke gefangen werden, wurde 2014 eingeführt. Gegenwärtig besagen die Vorschriften, dass alle nicht heimischen Fische und identifizierbare Cutthroat x Regenbogenforellen-Hybriden flussaufwärts der Knowles Falls getötet werden müssen. Selektive Entnahmen durch Elektrofischerei werden seit 2013 jährlich im Lamar Valley durchgeführt. Im Jahr 2019 wurden 7 % der bei Elektrobefischungen flussaufwärts des Lamar River Canyon entnommenen Fische als Regenbogen- oder Hybridforellen eingestuft. Dieser niedrige Prozentsatz steht in starkem Kontrast zu den Arbeiten, die flussabwärts des Canyons durchgeführt wurden.
Im Jahr 2015 wurden flussabwärts der Lamar River-Brücke 136 Fische beprobt. Anhand der Feldidentifizierung waren 48 % Yellowstone-Kutthroat-Forellen, 19 % Regenbogenforellen und 31 % Hybriden. Die meisten dieser Fische wurden im Rahmen eines laufenden Forschungsprojekts mit Funksendern oder passiven integrierten Transpondern (PIT) markiert, um festzustellen, ob Yellowstone-Kutthroat-, Regenbogen- und Hybrid-Forellen dieselben Gebiete zum Laichen und zum Laichzeitpunkt nutzen und um Informationen über Managementmaßnahmen zu erhalten.
Slough Creek
Im Slough Creek wurden in den letzten zehn Jahren immer häufiger Regenbogen-Kutthroat-Forellen-Hybride gefunden. Im Gegensatz zum Lamar River ist der Slough Creek kleiner, und es wurde eine Barriere für die Fischwanderung flussaufwärts errichtet. Da die Barriere vorhanden ist und die Regenbogenforellen nicht mehr in das System eindringen können, lassen sich die vorhandenen Regenbogen- und Hybridforellen durch Angeln und Elektrofischerei wirksam bekämpfen.
Soda Butte Creek
Bachforellen wurden im Soda Butte Creek außerhalb der Parkgrenzen angesiedelt und breiteten sich in den frühen 2000er Jahren flussabwärts in die Parkgewässer aus. Ursprünglich waren die Bachforellen in den Oberläufen durch eine chemische Barriere isoliert, die durch die Kontamination der Minen flussaufwärts von Cooke City, Montana, entstanden war. Als die Abraumhalden abgedeckt wurden und sich die Wasserqualität verbesserte, wanderten die Bachforellen flussabwärts und begannen, sich negativ auf die Cutthroat-Forelle auszuwirken.
Fast zwei Jahrzehnte lang reichten die behördenübergreifenden Elektrobefischungen aus, um die Bachforellenpopulationen niedrig zu halten, konnten aber die Ausbreitung nicht verhindern. Mit der Zeit breitete sich die Bachforelle flussabwärts aus und wurde zu einer Bedrohung für den Lamar River. Außerdem wurden bei den Cutthroat-Forellen flussaufwärts des Ice Box Canyon immer wieder Hybridisierungen mit Regenbogenforellen festgestellt.
Im Jahr 2013 wurden die Ice Box Falls so verändert, dass sie eine vollständige Barriere für die stromaufwärts gerichtete Fischwanderung bildeten, wodurch die Bedrohung durch nicht heimische Fische, die flussaufwärts wanderten, vollständig beseitigt wurde. Bei der chemischen Behandlung im Jahr 2015 wurden fast 450 Bachsaiblinge entfernt. Bei einer zweiten Behandlung im Jahr 2016 wurden nur zwei Bachsaiblinge aus dem Soda Butte Creek gesammelt. Seit 2017 wurden bei eDNA- und Elektrofischereiproben sowie bei Elektrofischerei-Umfragen keine Bachsaiblinge im System nachgewiesen. Dies ist ein guter Hinweis darauf, dass eine vollständige Abtötung im Abfluss erreicht wurde.
Elk Creek Complex
Im Elk Creek gibt es eine natürliche Kaskadenbarriere kurz vor der Einmündung in den Yellowstone River. Die Kaskade hinderte Fische daran, das System auf natürliche Weise zu bevölkern, so dass der Elk-, Lost- und Yancey-Bachkomplex (Elk Creek Complex) fischlos war, als er in den frühen 1920er Jahren erstmals mit Cutthroat-Forellen besetzt wurde. Im Jahr 1942 wurden die Bäche mit Bachforellen besetzt, was zum vollständigen Verlust der Cutthroat-Forellen führte.
Der Elk Creek Complex wurde von 2012 bis 2014 jährlich mit Rotenon behandelt, um die Bachforellen zu entfernen. Nachdem die Bachforelle entfernt worden war, begann die Wiederansiedlung der heimischen Yellowstone Cutthroat Forelle. Antelope und Pebble Creeks lieferten Fische für den Besatz des Elk Creek Complex im Oktober 2015. Weitere Besatzmaßnahmen fanden 2016 und 2017 statt. Die natürliche Reproduktion wurde 2017 auch bei Elektrobefischungen dokumentiert.