Schmelzkurve der Nukleinsäure, die die Hyperchromie in Abhängigkeit von der Temperatur zeigt
Die Messung der Lichtabsorption ist wichtig für die Überwachung des Schmelzens und Vernetzens der DNA. Bei der Schmelztemperatur (Tm) ist die DNA halb denaturiert und halb doppelsträngig. Wird die Temperatur unter den Tm-Wert gesenkt, verbinden sich die denaturierten DNA-Stränge wieder zu einem DNA-Doppelstrang. Wenn die Temperatur über dem Tm-Wert liegt, ist die DNA denaturiert.
Da das Schmelzen bei einer bestimmten Temperatur fast sofort eintritt, würde die Überwachung der Absorption der DNA bei verschiedenen Temperaturen die Schmelztemperatur anzeigen. Indem sie die Temperatur ermitteln, bei der die DNA geschmolzen und geglüht ist, können Wissenschaftler DNA-Stränge trennen und sie mit anderen DNA-Strängen verbinden (Annealing). Dies ist wichtig für die Schaffung von Hybrid-DNAs, die aus zwei DNA-Strängen aus verschiedenen Quellen bestehen. Da sich DNA-Stränge nur verbinden können, wenn sie ähnlich sind, kann die Schaffung von Hybrid-DNAs auf Ähnlichkeiten zwischen Genomen verschiedener Organismen hinweisen.