Die Bankangestellten hielten den Dieb für einen Polizeibeamten und akzeptierten seine Geschichte über die Bombe, weil zuvor Drohbriefe an den Bankdirektor geschickt worden waren. Es stellte sich heraus, dass der Rauch und die Flammen von einer Warnfackel herrührten, die er unter dem Auto gezündet hatte. Irgendwann ließ der Dieb das Auto der Bank stehen und lud die Metallkisten in ein anderes, zuvor gestohlenes Auto um. Auch dieses Auto wurde verlassen, und die Kisten wurden erneut in ein anderes, zuvor gestohlenes Fahrzeug gebracht.
Am Tatort wurden 120 Beweisstücke zurückgelassen, darunter das weiß lackierte „Polizeimotorrad“. Bei den Beweismitteln handelte es sich jedoch hauptsächlich um gewöhnliche Alltagsgegenstände, die absichtlich verstreut wurden, um die polizeilichen Ermittlungen zu verwirren.
Ein 19-jähriger Mann, der Sohn eines Polizeibeamten, wurde kurz nach dem Raubüberfall verdächtigt. Er starb am 15. Dezember 1968 an einer Zyankalivergiftung. Er hatte kein Alibi. Das Geld wurde jedoch zum Zeitpunkt seines Todes nicht gefunden. Sein Tod wurde als Selbstmord gewertet, und er wurde als unschuldig betrachtet, wie es in den offiziellen Unterlagen heißt.
Eine massive polizeiliche Untersuchung wurde eingeleitet, wobei 780.000 Bildmontagen in ganz Japan veröffentlicht wurden. Die Liste der Verdächtigen umfasste 110.000 Namen, und 170.000 Polizisten waren an den Ermittlungen beteiligt – die größte Untersuchung in der japanischen Geschichte.
Am 12. Dezember 1969 wurde ein 26-jähriger Mann von der Mainichi Shimbun verdächtigt. Er wurde wegen eines anderen Vorwurfs verhaftet, hatte aber ein Alibi; der Raubüberfall ereignete sich an dem Tag, an dem er eine Prüfung ablegte. Da die Verhaftung unter Vorspiegelung falscher Tatsachen erfolgte, wurde der verhaftende Polizeibeamte, Mitsuo Muto, des Machtmissbrauchs beschuldigt.
Ein Freund des 19-jährigen Verdächtigen wurde am 15. November 1975, kurz vor Ablauf der Verjährungsfrist, in einem anderen Fall verhaftet. Er besaß einen großen Geldbetrag und wurde des Raubüberfalls verdächtigt. Er war 18 Jahre alt, als der Raub stattfand. Die Polizei fragte ihn nach einer Erklärung für den hohen Geldbetrag, aber er sagte nichts, und es konnte nicht bewiesen werden, dass sein Geld aus dem Raubüberfall stammte.