LIPID MAPS® abbreviations for glycerophospholipids (GP)
The LIPID MAPS® glycerophospholipid abbreviations (PC, PE, etc.) jsou zde použity pro označení druhů s jedním nebo dvěma radlovými postranními řetězci, kde jsou struktury postranních řetězců uvedeny v závorkách ve formátu „Headgroup(sn1/sn2)“ (např. PC(16:0/18:1(9Z)). Ve výchozím nastavení se předpokládá stereochemie R na uhlíku C-2 glycerolu a připojení hlavové skupiny v poloze sn3. Ve výchozím nastavení se také předpokládají acylové řetězce. Předpona „O-“ se používá pro označení přítomnosti alkyletherového substituentu, např. PC(O-16:0/18:1(9Z)), zatímco předpona „P-“ se používá pro 1Z-alkenyletherový (plasmalogenový) substituent, např. PC(P-16:0/18:1(9Z)).
Pro molekuly s opačnou stereochemií (S) na C2 glycerolové skupiny a připojením hlavové skupiny v poloze sn1 se ke zkratce připojuje specifikace stereochemie of. Používá se formát zkratky „Headgroup(sn3/sn2)“.
Pro molekuly s neznámou stereochemií na uhlíku C-2 glycerolové skupiny se ke zkratce připojí specifikace stereochemie of a struktura se nakreslí s neuvedenou stereochemií C-2.

.

Articles

Napsat komentář

Vaše e-mailová adresa nebude zveřejněna.