Klíčový rozdíl mezi snRNA a snRNP spočívá v tom, že snRNA jsou malé jaderné molekuly RNA, zatímco snRNP neboli malé jaderné ribonukleoproteiny jsou malé jaderné molekuly RNA s proteiny.
snRNA jsou nekódující, biologicky aktivní malé molekuly RNA o průměrné velikosti 150 nukleotidů. V přirozeném stavu jsou obvykle přítomny ve spojení s proteiny jako snRNP. Proto jsou snRNP malé jaderné RNA s několika proteiny specifickými pro snRNP. snRNP se podílejí na zprostředkování nebo regulaci posttranslačních dějů zpracování RNA, jako je sestřih atd. Jak snRNA, tak snRNP se nacházejí v jádře eukaryotických buněk.
CONTENTS
1. Přehled a hlavní rozdíly
2. Co je snRNA
3. Co je snRNP
4. Podobnosti mezi snRNA a snRNP
5. Co je snRNA? Srovnání vedle sebe – snRNA vs snRNP v tabulce
6. Shrnutí
Co je snRNA
snRNA znamená malá jaderná RNA. Jedná se o malé jaderné molekuly RNA, které se nacházejí ve štěpných skvrnách a Cajalových tělíscích buněčného jádra eukaryotických buněk. Molekula snRNA má průměrnou délku 150 nukleotidů. Tyto snRNA jsou přepisovány pomocí pol II a pol III. Hlavní funkcí snRNA je zpracování pre-messengerové RNA (hnRNA) v jádře. Podílejí se především na zprostředkování nebo regulaci posttranslačních procesů zpracování RNA, jako je sestřih. Díky působení snRNA dochází k přesnému zarovnání a správné excizi intronů. Kromě toho se snRNA podílejí na regulaci transkripčních faktorů (7SK RNA) nebo RNA polymerázy II (B2 RNA) a udržování telomer.
Obrázek 01: snRNA
snRNA jsou nekódující RNA. Patří do třídy vysoce hojných biologicky aktivních RNA lokalizovaných v jádře. Jsou vždy spojeny s molekulami bílkovin a existují jako malé jaderné ribonukleoproteiny (snRNP). Existují dva hlavní typy snRNA jako snRNA třídy Sm a snRNA třídy Lsm. U1, U2, U4, U4atac, U5, U7, U11 a U12 jsou snRNA třídy Sm, zatímco U6 a U6atac jsou snRNA třídy Lsm.
Co je snRNP?
snRNP je malá jaderná molekula RNA ve spojení s bílkovinami. Obecně platí, že každá snRNP obsahuje jednu snRNA a mnoho molekul bílkovin. snRNP jsou tedy malé jaderné molekuly RNA a bílkoviny. snRNP spolu s mnoha dalšími doplňkovými bílkovinami tvoří komplex zvaný spliceosom, kde probíhá sestřih RNA. snRNP potřebují ke sestřihu intronů jak část RNA, tak část bílkovin. RNA složka je zodpovědná za endonukleázové řezy, protože má enzymatickou aktivitu. Existují různé typy snRNP a stříhají na různých místech.
Obrázek 02: snRNP ve spliceosomu
Kromě sestřihu se snRNP podílejí na jaderném zrání primárních transkriptů v mRNA, regulaci genové exprese, dárci sestřihu v nekanonických systémech a na zpracování 3′ konce histonových mRNA závislých na replikaci. Existují dvě zvláštní skupiny snRNP jako malé nukleolární RNP (snoRNP) a malé RNP s Cajalovým tělem (scaRNP).
Jaké jsou podobnosti mezi snRNA a snRNP?
- Jak snRNA, tak snRNP mají malé jaderné molekuly RNA.
- SnRNA se spojují s proteiny a vytvářejí snRNP.
- Každá snRNP obsahuje jednu snRNA.
- Obě snRNA i snRNP se nacházejí v jádře eukaryotických buněk.
Jaký je rozdíl mezi snRNA a snRNP?
snRNA je malá nekódující molekula RNA lokalizovaná v jádře eukaryotické buňky, zatímco snRNP je komplex jedné snRNA a specifických proteinů snRNP. snRNPS jsou malé jaderné ribonukleoproteinové částice. snRNA je pouze malá molekula RNA, zatímco snRNP je komplex molekuly snRNA a pevně vázaných proteinů. To je tedy klíčový rozdíl mezi snRNA a snRNP.
Níže uvedená infografika ukazuje rozdíly mezi snRNA a snRNP v tabulkové podobě.
Shrnutí – snRNA vs snRNP
snRNA je třída nekódujících malých jaderných RNA lokalizovaných v eukaryotickém jádře. Plní důležité funkce související se sestřihováním intronů a dalším zpracováním RNA. V přirozeném stavu je snRNA spojena s proteiny a existuje ve formě malých jaderných ribonukleoproteinových částic (snRNP). snRNP se spolu s mnoha dalšími proteiny podílejí na tvorbě komplexu spliceosomu, aby bylo možné provádět sestřih RNA. Tím je tedy shrnut rozdíl mezi snRNA a snRNP.
Odkaz:
1. Stone, Lauren B a Kasandra J Riley. „Malé jaderné ribonukleoproteiny (SnRNP)“. Wiley Online Library, American Cancer Society, 15. 8. 2014, onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/9780470015902.a0005038.
2. „Small Nuclear RNA.“ ScienceDirect Topics, dostupné zde.
Obrázek s laskavým svolením:
1. „RF00003“ – z databáze Rfam (Public Domain) via Commons Wikimedia
2. „Spliceosome ball cycle new2“ By JBrain – (CC BY-SA 2.0 de) via Commons Wikimedia
.